一年一度的影响因子又发布了,各种影响因子汇总的文章瞬间刷爆了朋友圈。
作为本领域的专业公众号,一直想找介绍系统介绍一下本领域的杂志,借此机会,来简介一下本领域的杂志、影响因子和分区,为同行阅读文献的选择、杂志投稿、毕业升职加薪助力。
2018我要实现自己一个小目标,许愿吧!!!
后台回复影响因子,获得2018最新完整版影响因子、中科院分区、精选本领域杂志影响因子等详细信息。
综合类
自然 Nature
期刊简介:IF(2018): 41.577; 中科院一区;周刊;年文章数879篇。
点评:公认最顶级的综合期刊,影响因子多年稳定在40左右,一直位于CNS之首,近年来微生物组文章多次成为封面,也是同行神往的杂志。但一年仅800多篇的位置,来自全球所有领域的竞争,发表一篇还是相当困难的。其拒稿率有多高,相信感受过其投稿被拒的同行们应该深有体会。
Nature还是比较喜欢菌群研究论文的,近一年来我们收到最后的解读投稿就来自本杂志,相关链接如下:
- Nature替宠物正名:宝宝身体好,猫狗不可少!
- Nature: 培养组学—高通量细菌分离培养鉴定
- Nature综述:宏基因组关联分析
- Nature:根系菌群参与磷胁迫和免疫的平衡
- Nature: EMP揭示地球多尺度微生物多样性
- Nature:人类肠道微生物组的肠型
- Nature:如何做一篇肠道菌群免疫的顶级文章-高盐与高血压
- Nature:肠道菌群代谢物调节肠道与免疫
- Nature: 拟南芥根微生物组的结构和组成
- Nature: 地球上最古老的热液喷口发现早期生命迹象
- Nature: 甘露糖苷选择性抑制致病性大肠杆菌
- Nature: 来自细菌的通告——群体感知效应
- Nature:乙酸盐通过介导微生物-脑-β细胞轴促进代谢综合征
而且这些全是纯Nature的文章,如果加上其子刊和综述类,占比可达本公众号涉及文章的一半以上,可见Nature系统在本领域的统治地位般的影响力。
下段引自genemedical上对CNS的评论,感觉很有意思分享给大家
作为三种相互独立的期刊,新词“CNS”已经成为科研工作者,包括学生、技术员、教授口中出现频率最高的词汇之一。在这里没有列出它们的影响因子,因为列出来也毫无意义!诸君估计会问:为什么毫无意义?是因为在乎它们影响因子的人永远也发不了CNS,而能发CNS的人肯定也不在乎其影响因子了。这三个期刊的威力,可以说是能让一个民工瞬间晋升为博导的神器。三者之间的对比,无论它们是20分、30分、抑或是40分,都没有太大区别,其名字本身就是碾压了SCI影响因子的存在。虽然我等可能终身无望发表,但也无碍于我们对它们进行憧憬,就如同笔者虽然买不起“百达翡丽”,但也可以去专柜欣赏把玩一番。CNS虽然都高大上,但是其风格还是各有侧重。从篇幅上来说,Cell篇幅最长,Nature次之,Science最短。其中Cell读起来最为畅快,故事完整,逻辑清晰,思路缜密,意义重大,而Nature和Science,通常正文只有2-3页,3-4组图,其篇幅偏短,字体偏小,晦涩难懂,让人感觉每一句话都暗藏玄机,读起来浑身不爽。通常还要打开几十页的补充材料,与正文相互比证,短短的几页文字阅读时间通常比十几页的Cell还要长。至于CNS的投稿要求,笔者就不展开介绍了,以免美捷登认为我有骗取稿费之嫌。
自然系统等级简介
首先要知道,自然杂志是一个多达50本杂志的出版集团,自上而下分为五个等级体系,每一级如果被拒稿可依次往下申请转稿。
- 自然。综合期刊,接受最顶级的研究,同时要考虑非同行的读者可以阅读的要求。每年平均800篇文章,版面极稀缺。
- 自然子刊(Nature XXX)。XXX代表专业领域顶级期刊,影响因子范围10 - 40,只是学科不同,但不影响其作为各领域顶级期刊的地位。虽然自然生物技术前几年引影响因子高于自然,但很多文章仍是自然拒稿转投的产物。自然主刊的认可度和传播影响是其它杂志无法比拟的。
- 自然通讯(Nature Communication)。开创性研究成果,主要承接自然及子刊拒稿的顶级研究。开放获取,但收取出版费(虽然子刊有可能没有通讯IF高,但定位是高于通讯的)。影响因子稳定,发稿量年均3000多篇,包含有中国研究机构的文章达500多篇。
- 通讯系列(Communications XXX)。承接自然子刊和通讯拒稿,要求有一定创新性研究成果,今年刚开始发行,最早也要2021年才会有影响因子,预测影响因子会在6-10分之间,其中与我们相关的通讯生物(Communications Biology)很可能在8分以上。https://www.nature.com/commsbio/
- 科学报告(Scientific Reports)。即能承接上面4级筛选后的文章,肥水不流外人田;又可以抢占开放获取市场巨大的蛋糕,文章只要求科学性,不要求创新性,接收率60%。年发表文章2万多篇,仅16年包括有中国单位(包括中国机构主导和参与)文章7700多篇。要知道每篇文章的出版本费高达人民币1.12万元,2万篇文章的资金流水可达2亿多元。
https://www.nature.com/srep/
虽然目前自然出版集团杂志种类不多,但占领了各领域的高端用户,并作凭借其影响力,火力全开吸纳中低端用户,5级金字塔模式——精确满足不同层次客户,在科研领域的影响力无人能比。
科学 Science
期刊简介:IF(2018): 41.058; 中科院一区;周刊;年文章数806篇。
期刊网址:http://www.sciencemag.org/
点评:顶级的综合期刊,生物领域CNS三巨头之一,文章正文篇幅短小,题材偏科普,要求受众广泛。影响因子逐年上升,看来照顾非专业读者才更有前景,近年来微生物组文章多次成为封面,也是同行神往的杂志。如上图左1的封面即为中科院微生物所王军老师一作的代表性研究。
Science也比较喜欢菌群研究,本平台导读过如下相关成果:
- 哈扎人菌群季节变化——3分和30分文章差距在哪里?
- Sciences:用膳食纤维”钓”出15株缓解糖尿病的细菌!
- Science: 肠道微生物可以转移到肝脏促进先天性免疫疾病发生
- 尸体死亡时间预测——16S+功能预测发Sciences
细胞 Cell
期刊简介:IF(2018): 31.398; 中科院一区;双周刊;年文章数701篇。
期刊网址:https://www.cell.com
点评:生物领域顶级期刊,CNS三巨头之一,文章正文篇幅长,要求机理解析清楚,学术性非常强,插图摘要(Graphic Abstract)是其杂志的一大特色,影响因子稳定在30左右。
今年三月推出的菌群专刊上(上图左1),让无数同行为之疯狂:
本平台导读过如下相关成果,4篇全是综述:
为什么我们没有推送过Cell文章的Aritle文章?因为文章太长,无论是编辑整理,都不太适合大众阅读。在文献科普导读领域,有热心肠己经非常专业了,有更深层次需求的专业人士,自然会仔细阅读原文。
美国科学院院报 PNAS
期刊简介:IF(2018): 9.504; 中科院一区;周刊;年文章数约4000篇。
期刊网址:http://www.pnas.org/
点评:其全称为 Proceedings of The National Academy of Sciences of The United States of America。曾经是综合期刊类影响因子世界第三,现己被后起之秀Nature Communication、Science Adavances等新兴期刊超越。但其强大的院士编委团队、总引用量还是可以和CNS比肩的。比较有特点的是院士贡献机制,每位美国科学院院士(包括外籍)每年最多可使用三次Contribute的机会,即采用审稿人指定两位同行院士直接审稿的机制。有人认为Contribute有灌水嫌疑,也有人认为此类文章更有价值(用人单位更愿意选择有多篇Contribute PNAS的作者作为引进人才,正是看中你院士导师对你的认可,和他强大的院士朋友圈,万一投稿不顺还可以求助前老板发动技能来个PNAS保底)。
值得注意的是,综合杂志上发表的生物学文章,一般真实引用都是高于杂志影响因子的(因为生物圈子足够大,学科交叉强,需要引文偏多三大原因),都是杂志中拉分的主力。如我们报导过的下面这篇文章,发表不到三年,引用297次,比Nature平均引用还高一倍。
- PNAS:水稻微生物组
微生物组领域
ISME Journal
期刊简介:Nature子刊,全称Multidisciplinary Journal of Microbial Ecology(微生物生态交叉学科杂志),IF(2018): 9.520; 中科院一区;年文章数346篇。微生物领域老牌顶级杂志,近5年发稿量和影响因子非常稳定。
期刊网址:http://www.nature.com/ismej/index.html
微生物组 Microbiome
期刊简介:IF(2018): 9.133; 中科院一区;年文章数69篇。
期刊主页:https://microbiomejournal.biomedcentral.com/
本领域我个人最喜欢专业期刊,名字起的好,发展没烦恼。当年我们创办公众号就想注册微生物组
这个名字,结果被人抢注了。只能退而求其次选择了宏基因组
。
本杂志获得影响因子仅有3年(微生物组兴趣也没几年),发文量不多,但在同行中影响很大,我们也导读过其多篇文章,偏方法多一些,估计将来会稳中有升:
- Microbiome: 室温存储样本方法比较
- Microbiome:微生物组研究中你必须注意的细节
- Microbiome:HiSeq平台16S扩增子文库构建方法
- Microbiome:植物根际微生物组也有昼夜节律
- Microbiome: 简单套路发高分文章–杨树微生物组
- Microbiome:肠道菌群失衡促进高血压
- Microbiome:重新定义“卫生”概念
- MiBioGen联盟倡议:综合分析人类基因组与菌群关系研究
- Microbiome: 16S rRNA基因拷贝数应该被校正吗?
mBio
期刊简介: IF(2018): 6.689; 微生物学(二区)。近五年文章数稳定在480左右,影响因子也稳定于6以上,审稿周期平均1.4个月,由美国微生物学会主办。
期刊主页:http://mbio.asm.org/
微生物学前沿 Frontiers in Microbiology
期刊简介: IF(2018): 4.019; 微生物学 ( 二区 ),年文章数2200篇,影响因子稳定在4以上,审稿周期平均1.8个月。由于其巨大的发行量,我们平时会经常看到它的文章,近年来我国占比猛增,如16年有438篇。
期刊主页:http://journal.frontiersin.org/journal/microbiology
CNS子刊
自然生物技术 Nature Biotechnology
期刊简介:IF(2018): 35.724; 中科院一区;年文章数455篇。
原来一直40以上,今年跳水,但绝对不错影响它作为生物领域技术一哥的行业地位。
此刊也发表有大量本领域的方法、软件、测评的文章,一年内我们报导了5篇之多:
- PICRUSt——16S预测宏基因组
- DNA提取也能发Nature?
- NB:实验vs分析,谁对结果影响大
- Nat. Biotechnol.:高通量测序16S及18S rRNA全长
- Nat. Biotechnol.: 宏表观组—DNA甲基化辅助宏基因组binning
自然方法 Nature Methods
期刊简介:IF(2018): 26.919; 生物化学研究方法 ( 一区 );年文章数300篇左右。
方法学神刊,影响因子在30左右波动,生物学软件方法、评测类文章能发于此,是很多同行的追求(极少数可发NB,但可望而不可及),此杂志要求不仅要软件好用,更要结合具体科研项目提供新的发现。下有两篇我们介绍过的文章,分别为软件评价,和比对较件:
Salmon是一个能看出平台重要性的例子。同一个软件在bioRxiv上两年多才引34次,发布在Nature Methods上几个月就引用64次。单位时间差距至少5倍以上,所以好方章有好的宣传平台,影响力不言而喻。
自然综述微生物 Nature Reviews Microbiology
期刊简介:IF(2018): 31.851; 微生物学 (一区);年文章数150篇。随着微生物组领域大热,该杂志近5年影响因子持续走高,今年直接提高5分。可见微生物组领域的大热势不可挡。
作为连续走高的30分以上综述,确实篇篇给力,只要和你的研究相关,确实值得精读,一篇顶百篇,超级系统的入门材料,系统文献一网打尽。还不知道如何入行的,快找两篇和你相关的文章,读懂读透,可最高效入行。本平台报导过如下三篇:
自然微生物 Nature Microbiology
期刊简介:IF(2018): 14.078; 微生物学 (四区,因为之前没有IF,今年重评肯定回1区);年文章数132篇。随着微生物组领域大热,自然杂志虽然已经有ISME统治微生物领域,但也继续发力创办了微生物学子刊,该杂志今年首次获得影响因子即破14,将来稿源会更加充足,水平有望进一步提升,直接填补了本领域从40分(CNS)到9分(Microbiome、ISEM J)中间的空白地带。会与Cell Host & Microbe竞争专业第一的位置,且稿件研究内容更广泛。
在已经有Nature Reviews Microbiology的条件下,该杂志仍继续约大牛发综述,保证其影响因子处于高位。
自然通迅 Nature Communication
期刊简介:IF(2018): 12.353; 中科院一区;年文章数3685篇。
影响因子缓慢持续走高,而其中的生物学文章更是高手中的高手,是杂志保护12+的拉分能手。如:
其它自然子刊
自然子刊的成员非常之多,但定位均高于Nature Communication,虽然有些子刊影响因子低于NC,但也是有被拒后转稿至NC的机会。
下方再简介三个我们报导过菌群文章的相关子刊
Nature Medicine:IF(2018): 32.621; 中科院一区;年文章数303篇。
Nature Genetics:IF(2018): 27.125; 遗传学 (一区);年文章数310篇。
Nature Plant:IF(2018): 11.471; 植物学 (一区)。 曾经的植物学霸主Plant Cell目前只有8.228。
环境科学
水研究 Water Research
期刊简介: IF(2015-2016): 7.051; 二区,年文章数651篇,审稿周期平均2.0个月。
期刊主页:https://www.journals.elsevier.com/water-research/
环境科学与技术 Environmental Science & Technology
期刊简介: IF(2018): 5.869; 二区,年文章数1,47。
期刊主页:https://pubs.acs.org/journal/esthag/
环境微生物 Environmental Microbiology
期刊名称:Environmental Microbiology
期刊简介:IF(2018): 4.974; 微生物学 (二区),月刊;年文章数500篇。
期刊网址:http://onlinelibrary.wiley.com/journal/10.1111/(ISSN)1462-2920
医学顶级期刊
医学领域四大神级医学周刊是我们医学生的梦想。其按照影响因子出场如下:
- New England Journal of Medicine (NEJM, 79.258, 新英格兰医学杂志)
- Lancet (Lancet, 53.254, 柳叶刀)
- Journal of the American Medical Association (JAMA, 47.661, 美国医学协会杂志)
- British Medical Journal (BMJ, 23.259, 英国医学杂志)
这四个杂志发表很多微生物的文章,但我的研究方向与医学没有半毛钱关系,个人了解不多,离我也非常遥远,话不多説。
Gut
期刊简介:IF(2018): 17.016; 微生物学 (二区),月刊;年文章数500篇。近几年肠道菌群大热,Gut上也表达了大量菌群研究的工作,每期必须Gut Microbiota栏目,也推动了本杂志影响因子5连涨,从10分达到今年17。
下文是中科院北京生科院赵方庆团队近期作品,由一作导读和分享PPT。
- 一作解读Gut:人体最初的微生物起源与生殖健康
国内杂志推荐
目前国内有很多高水平的杂志了,而且也非常关注微生物组领域的研究,有好成果发表在国内好杂志,不是更好吗?
GigaScience
期刊简介:IF(2018): 7.267; 综合学科 (二区);年文章数50篇左右。大家亲切的称它为华大学报,关注大数据还是有钱途的。
我们报导过其中两篇,分别为数据分析框架和MWAS分析的工作,如下:
- GigaScience:ASaiM基于Galaxy微生物组分析框架
- GigaScience:植物MWAS研究—谷子产量与微生物组关联分析
此外,具我所知,我们宏基因组0号群里的中农周欣教授,新加坡的李陈浩同学都在此杂志上发表过多篇高水平文章,值得关注。
Genomics Proteomics & Bioinfomatics
期刊简介:IF(2018): 6.615。中科院基因组所主办的杂志,今年首次获影响因子即破6,文章偏生信、基因组和蛋白组,非常关注宏基因组。大家亲切的称它为基因组所刊,近期还成立了中国的大数据中心GSA,无论是投稿,还是数据共享,都值得同行关注。
小编在4年前投过此杂志,审稿和后期处理速度很快,从投到接收不到一个月,其工作效率可见其前途。
Protein & Cell
期刊简介:IF(2018): 6.228。中科院北京生科院所主办的杂志,饶子和院士任主编,近5年从2.8分稳步增长,今年首次影响因子破6,上个月还组织了微生物组专刊,值得同行关注。
期刊网址:http://www.protein-cell.org/
Journal of Genetics and Genomics
期刊简介:IF(2018): 4.066。中科院遗传发育所、中国遗传学会主办的杂志,主编薛勇彪,影响因子近5年稳步增长并翻倍,今年首次破4,预计两年内可实现破5,值得同行关注。
期刊网址:http://www.jgenetgenomics.org/
Science China-Life Sciences
期刊简介:IF(2018): 3.085。中国科学生命科学,由中科院主办,李家洋院士任主编,今年影响因子破3,预计影响因子将持续走高。审稿速度快,上图封面文章从投稿到接受只有7天,可见编辑部的工作效率,将来必有更大发展。
目前已经开始关注本领域的研究,如今年本月的封面文章即为水稻微生物组相关工作,值得同行关注:
- 手把手带你重现菌群封面文章全部结果图表
小知识:影响因子
影响因子的计算
ISI每年出版JCR期刊引用报告 (Journal Citation Reports)评估期刊的影响力。
JCR对12000多种期刊(网络版) 之间的引用和被引用数据进行统计、运算,并针对每种期刊定义了影响因子 (IF: impact factor)等指数加以报道。
影响因子计算如下:IF = (某刊前2年发表论文在该年的被引用次数) / (该刊前2年发表论文总数)
提高引响因子的十条建议
根据上面的计算公式,我们发现可以通过增大分子(引用次数)、减小分母(论文总数)来快速提高影响因子。
具体的作法有哪些呢?
- 编辑的眼光:倾向选择将来2年内容易高引的方向和研究内容;
- 出版平台:同样的文章在Nature大平台曝光会比在bioRxiv上引用高5倍;
- 社交平台:宣传很重要,成果由编辑部、作者共同经tweet、朋友圈和公众号介绍给同行;文章和杂志同行没听过,如何引用你!推荐杂志社要办自己的自媒体,如公众号,更要多与一些同行大号合作,如BioArt、植物科学最前沿、热心肠先生等合作。当然我们的“宏基因组”在本领域也是有一定影响力的,欢迎同行杂志合作。
- 开放获取:没名气还收费,不作就不会死;
- 约稿大牛:这需要关系,发动编辑、主管领导、及二级人脉,无论什么手段,拿到高质量的稿件是最实在的东西;约大牛当guest editor:办热门领域专刊,只赚不赔;
- 发表时间:通常发表的年初的文章,在JCR统计中更容易积累更多引用,杂志社倾向将高引年初发表,低引年末发表;
- 口味的倾向:现在生物学交叉学科众多,如生信、软件、方法和宏基因组等热门方向,都是生物杂志应优先考虑的;
- 综述:综述通常是比研究更容易引用的;
- 可视化和分析软件:研究被引用频率不会太多,但通用的分析、可视化是很多人需要求,好的生物软件、在线server绝对受同行欢迎,NAR的很多引用都来自其web server专栏;
- 减小分母:注意,有些文章是可以被引用,但并不计入影响因子计算的论文总数,如letters to the editor、comment、news、annoucement、outlook、persepctive等类型(其特点是没有摘要或参考文献的文章)不会作为可引用文献被JCR统计。将潜在低引文章转换类型,增加这些类型文章的比例,增加存在感,减少低引文章作为分母。
最后:查询文章,下载原文,引影因子和趋势分析,推荐根哥的网站 http://www.geenmedical.com ,还有国人发稿量、国人占比、中国发稿分析等特色项目,更有官网入口、投稿须知、版面费说明和投稿的链接。这样专业的整理实在是太贴心了。
杂志影响因子列表
仅列出了本领域常用的3分以上杂志列表,按影响因子排序。
注:文本版方便复制、检索。
Full Journal Title | IF |
---|---|
NEW ENGLAND JOURNAL OF MEDICINE | 79.258 |
LANCET | 53.254 |
JAMA-JOURNAL OF THE AMERICAN MEDICAL ASSOCIATION | 47.661 |
NATURE | 41.577 |
SCIENCE | 41.058 |
NATURE BIOTECHNOLOGY | 35.724 |
NATURE REVIEWS MICROBIOLOGY | 31.851 |
CELL | 31.398 |
NATURE METHODS | 26.919 |
BMJ-British Medical Journal | 23.259 |
CLINICAL MICROBIOLOGY REVIEWS | 20.642 |
Cell Metabolism | 20.565 |
Cell Host & Microbe | 17.872 |
GUT | 17.016 |
Nature Microbiology | 14.174 |
FUNGAL DIVERSITY | 14.08 |
MICROBIOLOGY AND MOLECULAR BIOLOGY REVIEWS | 13.439 |
GENOME BIOLOGY | 13.214 |
Advanced Science | 12.441 |
Nature Communications | 12.353 |
TRENDS IN MICROBIOLOGY | 11.776 |
NUCLEIC ACIDS RESEARCH | 11.561 |
Science Advances | 11.511 |
Nature Plants | 11.471 |
FEMS MICROBIOLOGY REVIEWS | 11.392 |
Annual Review of Microbiology | 9.808 |
ISME Journal | 9.520 |
National Science Review | 9.408 |
PLOS BIOLOGY | 9.163 |
Microbiome | 9.133 |
Cell Systems | 8.982 |
Nature Reviews Urology | 8.089 |
WATER RESEARCH | 7.05 |
GigaScience | 7.267 |
CURRENT OPINION IN MICROBIOLOGY | 6.710 |
mBio | 6.689 |
GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS | 6.62 |
Protein & Cell | 6.228 |
PLoS Pathogens | 6.158 |
Environmental Science & Technology Letters | 5.87 |
Current Topics in Microbiology and Immunology | 5.829 |
mSystems | 5.750 |
BIOINFORMATICS | 5.481 |
Global Change Biology Bioenergy | 5.415 |
CLINICAL MICROBIOLOGY AND INFECTION | 5.394 |
ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY | 4.974 |
CRITICAL REVIEWS IN MICROBIOLOGY | 4.738 |
Journal of Oral Microbiology | 4.444 |
CELLULAR MICROBIOLOGY | 4.410 |
npj Biofilms and Microbiomes | 4.128 |
Journal of Genetics and Genomics | 4.066 |
Frontiers in Microbiology | 4.019 |
SYSTEMATIC AND APPLIED MICROBIOLOGY | 3.899 |
MOLECULAR MICROBIOLOGY | 3.816 |
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY | 3.633 |
Frontiers in Cellular and Infection Microbiology | 3.520 |
FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY | 3.495 |
INTERNATIONAL JOURNAL OF FOOD MICROBIOLOGY | 3.451 |
APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY | 3.340 |
INTERNATIONAL JOURNAL OF MEDICAL MICROBIOLOGY | 3.298 |
MEDICAL MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY | 3.202 |
Future Microbiology | 3.190 |
Annals of Clinical Microbiology and Antimicrobials | 3.155 |
JOURNAL OF INDUSTRIAL MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY | 3.103 |
Science China-Life Sciences | 3.09 |
后台回复影响因子,获得2018最新完整版影响因子、中科院分区、精选本领域杂志影响因子等详细信息。
Reference
Web of Science 需机构有权限才可访问 https://isiknowledge.com
微生物生态领域专业SCI期刊 https://mp.weixin.qq.com/s/gav_-neXagcvEUXcE8pNFg
临近毕业,微生物生态相关文章可以投稿哪些SCI杂志? https://mp.weixin.qq.com/s/ng5TLxzv4TSbUMF7E94SpA
你该知道的杂志分区和影响因子及2018最新影响因子下载 https://mp.weixin.qq.com/s/BWn7h_fcAfjFRWAMi-nWZg
GeneMedical文献检索和投稿选刊:http://www.geenmedical.com
维基百科-影响因子 Editorial policies that affect the impact factor https://en.wikipedia.org/wiki/Impact_factor
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