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RSS订阅转载 Cell Host & Microbe | 翟齐啸/张家超/黄适-揭示肠道细菌帮助缓解便秘的机制
研究论文●期刊：Cell Host & Microbe(IF:20.6)● DOI：https://doi.org/10.1016/j.chom.2023.10.011●原文链接: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1931312823004158● 第一作者：张程程●通讯作者：翟齐啸（zhaiqixiao@sina....
2025-02-04 07:01:51
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转载 iMetaOmics | 深圳大学李猛组综述沉积物中古菌的多样性和代谢潜能
点击蓝字 关注我们探索沉积物中古菌的生活：多样性、代谢潜力和生态角色iMeta主页：http://www.imeta.science综 述●原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.56●2025年1月28日，深圳大学李猛团队在iMetaOmics在线发表了题为“Unveiling the life of archaea in sediments: dive...
2025-02-04 07:01:51
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原创 MPB | 浙大王佳堃组-幼龄反刍动物粪便DNA提取及注意事项
幼龄反刍动物粪便DNA提取及注意事项DNA Extraction from the Faeces of Young Ruminants王佳堃*，杨斌，陈宏伟奶业科学研究所，动物科学学院，浙江大学，杭州，浙江*通讯作者邮箱: jiakunwang@zju.edu.cn 引用格式：王佳堃, 杨斌, 陈宏伟. (2021). 幼龄反刍动物粪便DNA提取及注意事项. // 微生物组实验手册.Bio-10...
2025-02-04 07:01:51
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原创 MPB | 山东农大高峥/周波-尾菜堆肥微生物组样品取样方法
尾菜堆肥微生物组样品取样方法Methods for Collection of Vegetable Waste Compost Microbiome Samples郭成1，董庆1, 2，张超1, 2，周波1, *，高峥1, 2, *1生命科学学院，山东农业大学，泰安，山东；2作物学国家重点实验室，山东农业大学，泰安，山东*通讯作者邮箱: gaozheng@sdau.edu.cn; zhoubo27...
2025-02-03 07:03:06
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转载 iMeta | 王梦芝/周平/杨庆勇-开发7类草食动物105种组织转录组数据库
点击蓝字 关注我们HTIRDB: 一个提供七种草食动物（105种不同组织）比较转录组分析的全组织转录组数据库iMeta主页：http://www.imeta.science研究论文●原文:iMeta(IF 23.8)●原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.267●2025年1月28日，扬州大学王梦芝，新疆农垦科学院周平，华中农业大学杨庆勇等团队在iM...
2025-02-03 07:03:06
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原创 你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(2025.2)
欢迎点击上方蓝色”宏基因组”关注我们！宏基因组是当今世界科研最热门的研究领域之一，为加强微生物组、生物信息学、生物技术等前沿交流学科技术和成果的交流传播，推动全球华人微生物组领域发展，中国青年科研人员自2017年创立“宏基因组”公众号，联合海内外华人同行共同打造本领域技术及思想交流平台。公众号每日推送，分享宏基因组领域最新成果、科研思路、实验和分析技术，目前分享3500+篇原创文章，17万+小伙伴...
2025-02-03 07:03:06
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转载 iMeta | 被引超6500次，发文248篇，平均引用26.23，百引耗时6天(2025/1/31)
iMeta 被引超6500次，发文248篇，平均引用26.23，百引耗时6天(2025/1/31)根据 Dimensions 网站统计，截止2025年1月31日，iMeta 己发表论文248篇，被引6506次，平均引用26.23，近两次百引平均耗时6天！2022、2023和2024年分别被引353、1627和4036次，2025年已被引487次，引用次数逐年攀升。iMeta 从第一篇文章2022年...
2025-02-02 07:02:44
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原创 Cell Host & Microbe | 普通拟杆菌影响艰难梭菌的生长动态和进化适应性
研究论文●期刊：Cell Host & Microbe(IF:20.6)● DOI：https://doi.org/10.1016/j.chom.2024.12.001●原文链接: https://www.cell.com/cell-host-microbe/fulltext/S1931-3128(24)00446-3● 第一作者：Jordy Evan Sulaiman●通讯作者：Op...
2025-02-02 07:02:44
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转载 Nature Microbiology | 代谢重组：微生物适应温度变化的关键机制
转载自环境微生物组学温度是影响微生物行为和生存的关键环境因子，不论是在自然界还是宿主内，微生物都需要面对温度的动态变化。然而，微生物如何通过内在机制调节生长速率以适应温度变化，长期以来仍是未解之谜。2024年12月13日，最新《Nature Microbiology》发表斯坦福大学和多所科研机构合作论文，系统解析了微生物通过代谢重组应对温度变化的机制，为理解生命系统的温度适应提供了全新视角。温度会...
2025-02-02 07:02:44
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原创 MPB | 南农韦中组-根系分泌物调控土壤微生物群落结构和功能的研究方法
根系分泌物调控土壤微生物群落结构和功能的研究方法Effects of Root Exudates on Mediating Composition And Function of Soil Microbiome杨天杰1，王震1，谷益安2，韦中1 *1江苏省固体有机废弃物资源化高新技术研究重点实验室/江苏省有机固体废弃物资源化协同创新中心/资源节约型肥料教育部工程研究中心/国家有机类肥料工程技术研究...
2025-02-02 07:02:44
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转载 男导师给女博士生在微信聊天时，发表情需要注意什么？
还有什么可以发的？宏基因组推荐1月10-12日，单菌基因组组装、注释、遗传表征、分子分型、系统进化和传播溯源2月21-23日，家系、肿瘤临床基因组/外显子组数据分析3月21-23日，高级转录组分析和R语言数据可视化3月28-30日，第二届全国基因组信息学大会4月11-13日，微生物组-扩增子16S分析5月11-13日，微生物组-宏基因组分析本公众号现全面开放投稿，希望文章作者讲出自己的科研故事，分...
2025-01-27 09:54:20
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转载 iMeta热点论文 | 安医大徐建光/张亨国组-口腔微生物工程化在心血管疾病治疗中的应用与前景...
点击蓝字 关注我们工程口腔微生物在心血管疾病治疗中的应用与前景iMeta主页：http://www.imeta.science综 述●期刊：iMeta（IF 23.8）●原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.197●2024年5月9日，安徽医科大学徐建光和张亨国团队在iMeta在线发表了题为 “Cardiovascular disease therap...
2025-01-27 09:54:20
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原创 Nature Microbiology | 朱升龙/陈永泉/梁鑫淼等-游离脂肪酸受体4通过肠道菌群调节饮食糖偏好...
游离脂肪酸受体4通过肠道菌群调节饮食糖偏好●期刊：Nature Microbiology(IF:20.5)● DOI：https://doi.org/10.1038/s41564-024-01902-8●原文链接: https://www.nature.com/articles/s41564-024-01902-8● 第一作者：Tingting Zhang, Wei Wang●通讯作者：X...
2025-01-27 09:54:20
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原创 MPB | 微生物所蔡磊组-基于二代测序的真菌基因组组装和注释
基于二代测序的真菌基因组组装和注释Assembly and Annotation of Fungal Genome Based on Illumina Sequencing马紫英1, 2，吴琦1，周欣1, 2，李宽1，蔡磊1 *1 中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室，北京；2中国科学院大学生命科学学院，北京*通讯作者邮箱：cail@im.ac.cn引用格式：马紫英, 吴琦, 周欣, 李宽,...
2025-01-27 09:54:20
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原创 Nature | 宿主代谢平衡微生物对胆汁酸信号的调节
宿主代谢平衡微生物对胆汁酸信号的调●期刊：Nature(IF:50.5)● DOI：https://doi.org/10.1038/s41586-024-08379-9●原文链接: https://www.nature.com/articles/s41586-024-08379-9● 第一作者：Tae Hyung Won, Mohammad Arifuzzaman, Christopher ...
2025-01-26 07:02:11
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原创 MPB | 西湖大学鞠峰组-微生物群落RNA稳定同位素探针技术 (RNA-SIP)
微生物群落RNA稳定同位素探针技术 (RNA-SIP)RNA-stable Isotope Probing for Microbial Communities张璐1,2，鞠峰1,2*1浙江省海岸带环境与资源研究重点实验室，工学院，西湖大学，杭州，浙江2 前沿技术研究所，浙江西湖高等研究院，杭州，浙江*通讯作者邮箱: jufeng@westlake.edu.cn引用格式：张璐, 鞠峰. (2021)...
2025-01-26 07:02:11
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转载 iMeta热点论文 | 引用16000+，海普洛斯陈实富发布新版fastp，更快更好地处理FASTQ数据...
点击蓝字 关注我们使用fastp进行超快的FASTQ数据预处理、质量控制和去重iMeta主页：http://www.imeta.science方法论文●期刊：iMeta（IF 23.8）●原文链接DOI:https://doi.org/10.1002/imt2.107●2023年5月8日，海普洛斯生物科技有限公司陈实富在iMeta在线发表了题为“Ultrafast one-pass F...
2025-01-26 07:02:11
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转载 Cell | 赵方庆组建立人工智能驱动的空间蛋白质组学新技术
近年来，空间组学技术已成为解析组织异质性和复杂细胞相互作用的重要工具。尤其是空间转录组学，在胚胎发育、神经科学和疾病机制研究中展现了巨大潜力。然而，作为直接执行生物功能的核心分子，蛋白质的空间分布研究在技术上面临诸多挑战。现有空间蛋白质组学技术受限于质谱检测通量和高昂成本，难以兼顾高分辨率与大面积组织分析需求，限制了其在复杂组织研究中的广泛应用。2025年1月23日，中国科学院动物研究所的赵方庆团...
2025-01-25 07:03:45
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转载 Cell | 王二涛研究组在植物区分共生与病原微生物机制的研究中取得重要进展
科研进展北京时间2025年1月24日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心王二涛研究团队在植物区分共生与病原微生物的分子机制研究中取得重要进展。该成果以“A pair of LysM receptors mediates symbiosis and immunity discrimination in Marchantia”为题在国际顶级学术期刊《细胞》（Cell）发表，建立了植物特异识别共生微生物...
2025-01-25 07:03:45
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原创 Cell Host＆Microbe | 乔杰/庞艳莉-肠道真菌塔宾曲霉通过次级代谢物促进多囊卵巢综合征...
肠道真菌塔宾曲霉通过次级代谢物促进多囊卵巢综合症●期刊：Cell Host＆Microbe(IF:20.6)● DOI：https://doi.org/10.1016/j.chom.2024.12.006●原文链接: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1931312824004736● 第一作者：吴佳玉●通讯作者：乔杰（ji...
2025-01-25 07:03:45
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转载 Genome Biology | 南洋理工章安妮组开发新的序列比对生信工具
研究论文●期刊：Genome Biology(IF:10.1)● DOI：https://doi.org/10.1186/s13059-024-03473-7●原文链接:https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-024-03473-7● 第一作者：Jeffry Gaston●通讯作者：Eric Alm (...
2025-01-24 07:02:56
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转载 Nature| 神奇突变：为植物根系打开微生物共生的绿色通道
在人类耕作了千年的土壤深处，植物与微生物的“地下同盟”正悄然塑造着地球的未来。这种关系不仅为植物提供生长所需的养分，也承载了科学家们对可持续农业的无限想象。 近日发表在《Nature》上的研究"Autoactive CNGC15 enhances root endosymbiosis in legume and wheat (自活性CNGC15促进豆科植物和小麦根系内共生)...
2025-01-24 07:02:56
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转载 深圳人从哪里来？
1000个深圳人中各省移民比例（数据来源:第七次全国人口普查）还是广东本省人最多，占了337人（33.7%）其次是湖南省，118人（11.8%）嗯……深圳不亏是湖南的“省会”然后前十分别是广西老表107人，湖北79人，江西66人，河南65人，四川56人，贵州32人，重庆22人，安徽17人。1000个深圳人的年龄分布（数据来源:第七次全国人口普查）30~34岁，占了151人（15.1%）1000个深...
2025-01-24 07:02:56
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原创 MPB | 浙大王谦等反刍动物消化道微生物CAZymes基因资源的挖掘与功能分析
反刍动物消化道微生物CAZymes基因资源的挖掘与功能分析Mining and Functional Characterization of CAZymes Derived from Gastrointestinal Microbiota in Ruminants王谦*，王佳堃，孙小宝，曹佳雯奶业科学研究所，动物科学学院，浙江大学，杭州，浙江*通讯作者邮箱: emirate14@zju.edu.c...
2025-01-24 07:02:56
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转载 北京大学现代农业研究院郭立实验室招聘公告
北京大学现代农业研究院郭立实验室招聘公告北京大学现代农业研究院是由北京大学与山东省人民政府共同建设的研究性公益二类事业单位。坐落于风景秀丽的潍坊市峡山生态经济开发区。根据课题研究发展需求，现面向社会公开招聘科研工作人员。一、招聘岗位：现因研究需要，诚聘副研究员/助理研究员/博士后若干名二、实验室介绍：郭立博士，北京大学现代农业研究院研究员（PI），园艺作物基因组学与合成生物学实验室主任。美国宾夕法...
2025-01-23 08:56:52
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转载 Nature | 黄三文团队系统揭示无性繁殖植物的基因组特征，提出马铃薯理想单倍型育种策略...
点击蓝字关注我们马铃薯是典型的无性繁殖作物，基因组高度杂合，存在大量有害变异，只有系统揭示马铃薯的基因组特征，才能有效实现“无性繁殖作物有性化育种”。前期已经开展的马铃薯泛基因组（Nature, 2022）尚未完整解析杂合二倍体的两套单倍型。因此，构建能够完整解析单倍型的图泛基因组，以全面捕捉杂合信息和单倍型多样性，对马铃薯有性杂交育种具有重要意义。“北京时间1月23日，中国农业科学院深圳农业基因...
2025-01-23 08:56:52
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原创 MPB | 中科院微生物所蔡磊组-基于扩增子数据的系统发育树的构建和展示
基于扩增子数据的系统发育树的构建和展示Construction and display of phylogenetic tree based on amplicon data周欣1, 2，马紫英1, 2，祁智慧3，刘永鑫4，蔡磊1, 2, *1真菌学国家重点实验室，中国科学院微生物研究所，北京；2生命科学学院，中国科学院大学，北京；3国家粮食和物资储备局科学研究院 北京；4植物基因组学国家重点实...
2025-01-23 08:56:52
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原创 MPB | 林科院袁志林组-野外树木根系取样及根际土收集操作规程
野外树木根系取样及根际土收集操作规程Protocol for Sampling of Root and Rhizosphere Soils from Trees in Natural Fields何兴华1, 2，杨预展1, 2，袁志林1, 2, *1林木遗传育种国家重点实验室，中国林业科学研究院，北京；2中国林业科学研究院亚热带林业研究所，杭州*通讯作者邮箱: yuanzl@caf.ac.cn引用...
2025-01-22 07:02:16
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转载 Cell | Peer Bork组-发现粪便微生物负荷是肠道微生物组变异的主要决定因素和疾病关联的混杂因素...
研究论文●期刊：Cell(IF:45.5)● DOI：https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.10.022●原文链接: https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)01204-2● 第一作者：Suguru Nishijima●通讯作者：Michael Kuhn（mkuhn@embl.de） &Pee...
2025-01-22 07:02:16
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转载 【Nature Microbiology】香港中文大学于君发现病原体肺炎克雷伯氏菌的肠-肝易位促进小鼠肝细胞癌...
2025年1月2日，香港中文大学于君团队在《Nature Microbiology》（IF=20.5）在线发表题为“Gut–liver translocation of pathogenKlebsiellapneumoniae promotes hepatocellular carcinoma in mice”的研究论文，该研究发现病原体肺炎克雷伯氏菌的肠-肝易位促进小鼠肝细胞癌。研究背景肝细胞...
2025-01-22 07:02:16
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转载 重要！国家杰青优青项目，改名字了！
据国家自然科学基金委消息，为持续深化科学基金人才项目改革，确保人才项目健康发展，切实起到激励人才成长的目的，避免“帽子化”等异化使用现象，自2025年起，将国家杰出青年科学基金项目更名为青年科学基金项目(A类)，将优秀青年科学基金项目更名为青年科学基金项目(B类)，将青年科学基金项目更名为青年科学基金项目(C类)。青年科学基金项目(A类)支持在基础研究方面已取得突出成绩的青年学者,面向世界科学前沿...
2025-01-21 08:09:29
60
转载 iMetaOmics | 中国农科院毕研亮组-精确消化道微生物群调节策略促进宿主健康
点击蓝字 关注我们精准微生物调控：调节消化道微生物群以促进宿主健康的策略iMeta主页：http://www.imeta.science综 述●原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.54●2025年1月14日，中国农业科学院毕研亮在iMetaOmics在线发表了题为“Precision microbial regulation: strategies f...
2025-01-21 08:09:29
194
原创 MPB | 原核微生物群落随机性和确定性装配过程的计算方法
原核微生物群落随机性和确定性装配过程的计算方法Calculation Method for Stochastic and Deterministic Assembly Processes of Prokaryotic Communities赵维1, 2，王兴彪1, 2，侍浏洋1, 2，朱婉瑜1, 2，马磊1, 2，王敬敬1, 2，徐松1, 2，杨榕1, 2，张小霞1, 2，韩一凡1, 2，黄志勇1...
2025-01-21 08:09:29
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转载 iMeta | 被引超6300次，发文248篇，平均引用25.47，百引耗时7天(2025/1/19)
iMeta 被引超6300次，发文248篇，平均引用25.47，百引耗时7天(2025/1/19)根据 Dimensions 网站统计，截止2025年1月19日，iMeta 己发表论文248篇，被引6316次，平均引用25.47，百引平均耗时7天！iMeta 从第一篇文章2022年2月21日上线，至2022年9月2日获得100+次引用，耗时193天；2022年10月26日被引200+次，百引耗时5...
2025-01-20 12:56:53
60
原创 MPB | 中国农科院李玉中组牧草种子内生真菌的分离、鉴定与保存方法
牧草种子内生真菌的分离、鉴定与保存方法Isolation, identification and preservation of endophytic fungi from forage seeds强晓晶1，李玉中2, *1中国农业科学院草原研究所，呼和浩特，内蒙古自治区；2中国农业科学院农业环境与可持续发展研究所，北京。*通讯作者邮箱：Lyz_caas@126.com引用格式：强晓晶, 李玉中....
2025-01-20 12:56:53
780
原创 Nature Microbiology | Grégoire Michoud组-绘制冰川融水多界微生物组的宏基因组多样性图谱...
绘制冰川融水多界微生物组的宏基因组多样性图谱●期刊：Nature Microbiology(IF:20.5)● DOI：https://doi.org/10.1038/s41564-024-01874-9●原文链接: https://www.nature.com/articles/s41564-024-01874-9● 第一作者：Grégoire Michoud●通讯作者：Grégoire...
2025-01-20 12:56:53
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转载 iMeta | 南医大余光创组-使用treeio和ggtree探索系统发育位置数据
点击蓝字 关注我们利用treeio和ggtree通过自定义可视化来探索系统发育放置不确定性的方法iMeta主页：http://www.imeta.science方法论文●原文:iMeta(IF 23.8)●原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.269●2025年1月12日，南方医科大学余光创团队联合香港大学、宁波大学等单位，在iMeta期刊在线发表了...
2025-01-20 12:56:53
164
转载 iMetaOmics | 李维勤/余艺文-重症急性胰腺炎自发性腹腔出血的遗传调控机理
点击蓝字 关注我们全外显子测序揭示FCGBP基因突变调控急性胰腺炎自发性腹腔出血及重症化进展iMeta主页：http://www.imeta.science研究论文●原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.52●2025年1月9日，南京大学李维勤和东南大学余艺文团队在iMetaOmics在线联合发表了题为“Whole Exome Sequencing Rev...
2025-01-19 07:03:07
157
转载 iMeta | 高海/王伟/李春/李蕾-探索多不饱和脂肪酸氧化物与急性心梗预后关系
点击蓝字 关注我们多不饱和脂肪酸来源的氧化脂质在ST段抬高型心肌梗死的预后及治疗作用研究iMeta主页：http://www.imeta.science研究论文●原文:iMeta(IF 23.8)●原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.266●2025年1月9日，北京安贞医院高海、广中医王伟、北中医李春和北医三院李蕾等在iMeta在线发表了题为“Th...
2025-01-19 07:03:07
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原创 MPB | 中科院微生物所蔡磊组-运用可培养组技术开展难培养真菌的分离和鉴定
运用可培养组技术开展难培养真菌的分离和鉴定Applying Culturomics Approach for the Isolation and Identification of Previously Uncultured Fungi周欣1, 2, #，李盟1, 2, #，马紫英1, 2，祁智慧3，黄君恩1, 2，蔡磊1, 2, *1真菌学国家重点实验室，中国科学院微生物研究所，北京；2生命科学...
2025-01-19 07:03:07
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Windows系统R语言4.0安装包合集(20200909)
2020-09-09
空空如也
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