AffinityPropagation ap聚类

AP聚类一般翻译为近邻传播聚类,07年被提出,其优点有: 

  • 不需要制定最终聚类族的个数 
  • 已有的数据点作为最终的聚类中心,而不是新生成一个族中心。 
  • 模型对数据的初始值不敏感。 
  • 对初始相似度矩阵数据的对称性没有要求。
  •  相比与k-centers聚类方法,其结果的平方差误差较小。

首先简要介绍一下AP算法,跟其他聚类算法的不同之处是,AP在开始时,将所有节点都看成潜在的聚类中心,然后通过节点之间的通信,去找出最合适的聚类中心,并将其他节点划分到这些中心下去,所以我们可以认为,AP算法所要做的事情就是去发现这些聚类中心。

AP的输入是一个节点间的相似度矩阵,S,其中S(i,j)表示节点i和节点j之间的相似度,也表明了,j作为i的聚类中心的合适程度,这个相似度的计算可以根据具体应用场景,这里未免误导不作相似度的假设。其中S(k,k)表示节点k作为k的聚类中心的合适程度,可以理解为,节点k成为聚类中心合适度,在最开始时,这个值是初始化的时候使用者给定的值,会影响到最后聚类的数量。

AP中节点间传递的消息为两类:吸引度和归属度。

首先,吸引度是节点i传递向节点k的信息,传达了节点k对节点i的吸引度,记为r(i,k),那么如何来衡量这个吸引度,其实吸引度是一个相对的概念,先前我们有相似度矩阵记录了k成为i的聚类中心的合适程度,那么这里我们只需要证明k比其他节点更合适了就可以了,那么其他节点是否合适这个如何进行衡量呢,是否合适其实就是看这两个节点是否相互认可,对于其他节点k'我们有s(i,k')表示节点k'

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AP聚类(Affinity Propagation Clustering)是一种基于图论的聚类算法,可以自动决定数据集中的聚类数目。它不需要指定聚类的数量,而是通过样本自身的相似性来确定聚类的个数和每个样本所属的类别。 下面给出一个用 Python 实现 AP 聚类的例子: ```python from sklearn.cluster import AffinityPropagation from sklearn import metrics from sklearn.datasets import make_blobs # 生成样本数据 centers = [[1, 1], [-1, -1], [1, -1]] X, labels_true = make_blobs(n_samples=300, centers=centers, cluster_std=0.5, random_state=0) # 计算相似度矩阵 af = AffinityPropagation().fit(X) cluster_centers_indices = af.cluster_centers_indices_ labels = af.labels_ n_clusters_ = len(cluster_centers_indices) # 输出聚类结果 print('Estimated number of clusters: %d' % n_clusters_) print("Homogeneity: %0.3f" % metrics.homogeneity_score(labels_true, labels)) print("Completeness: %0.3f" % metrics.completeness_score(labels_true, labels)) print("V-measure: %0.3f" % metrics.v_measure_score(labels_true, labels)) print("Adjusted Rand Index: %0.3f" % metrics.adjusted_rand_score(labels_true, labels)) print("Adjusted Mutual Information: %0.3f" % metrics.adjusted_mutual_info_score(labels_true, labels)) ``` 在上述代码中,我们使用了 `make_blobs()` 生成了一个三类数据集,然后使用 `AffinityPropagation()` 计算相似度矩阵并进行聚类,最后输出了聚类结果和聚类评估指标。 需要注意的是,AP 聚类算法的时间复杂度较高,因此对于大规模数据集可能不太适用。
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