关于KEGG报错问题的解决

一：最近，KEGG用起来会出现报错，如下所示：

fail to download KEGG data...
Error in download.KEGG.Path(species) : 
  'species' should be one of organisms listed in 'http://www.genome.jp/kegg/catalog/org_list.html'...
In addition: Warning message:
In utils::download.file(url, quiet = quiet, method = "libcurl",  :
  URL 'https://rest.kegg.jp/link/hsa/pathway': status was 'Failure when receiving data from the peer'

 网上也有很多比较好的，也可能行之有效的方法，比如：

1. 建明老师的方法是：

library(R.utils)

R.utils::setOption("clusterProfiler.download.method",'auto')

2.Y叔的：

options(clusterProfiler.download.method = "wininet")

3.或者改用其他下载方式：

目前的下载方式有“internal”、“wininet”（仅限Windows）、“libcurl”、“wget”和“curl”，其中有一个值“auto”：参见‘Details’和‘Note’。

由于的作者在linux上运行R&#