mimics教程案例1-骨折三维重建

骨折三维重建

1 打开软件新建工程,将数据导入
FILE -> New Project ->找到自己的数据 ->Next ->Open
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2 新建图层
SEFMENT -> New Mask ->选择阈值(合适的阈值是可以将骨骼边缘覆盖住)-> OK
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3 使用Region Grow(区域增长)提取骨骼,去除床板杂物
SEFMENT -> Region Grow ->鼠标需要点击窗口图像中的骨骼->OK
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4 复制骨骼,三维重建
选中需要复制的图层 -> 点击右键 -> Duplicate Mask
复制后点击三维预览,实时预览图层三维模型。观察三维模型可初步确定分割部位。
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5 实际目的:分割右侧髋骨,去除右股骨,骶骨。
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6 处理过程
点击三维模型,定位到CT图像对应层面,需要擦除两个骨骼的接触位置。
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7 提取右侧髋骨
擦除连接的位置后,点击SEGMENT ->Region Grow ->点击要提取的髋骨区域。
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技巧处理
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8 优化
(1)生成实体三维模型:右击图层 -> Calculate Part ->optimal ->calculate在这里插入图片描述
(2)调整三维模型透明度,进行填充
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填充 选中图层SEGMENT ->Smart Fill -> 选中像素 -> Fill Holes ->Erase ->OK
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(3)最后对优化后的图层再生成实体三维模型

(4)光滑模型
选中三维模型 -> 鼠标右键 -> Smooth -> 设置迭代次数和平滑参数 -> OK

扩展
显示其余的骨骼,可以使用布尔运算直接生成。
SEGMENT -> Boolean Operations Modify ->目标A:骨骼图层,目标B:右髋骨图层,操作:相减 ->Apply
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最后对得到的其他图层进行实体3D重建。

导出三维模型文件
右击模型 -> STL+ ->按住ctl选中需要导出的模型(可多选)-> add -> Output Format(选择保存模式,常用STL)-> Output Directory(选择保存路径)->Finish

其他方法:使用CT-Bone工具分割髋骨

  1. Bone Selection
    ADVANCED SEGMENT -> CT Bone ->设置阈值和敏感度 -> +选择需要提取的骨骼 -> -选择多余的骨骼 -> NEXT
    在这里插入图片描述
  2. Mask Threshold
    设置min和max值,表示在该区间的都是骨骼 -> Next在这里插入图片描述
  3. Finishing
    设置好距离和内部填充后 -> Calculate ->Finish
    在这里插入图片描述
    最后使用Calcuate Part得到三维模型
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