Origin将普通散点图升级为清晰的基因分组差异蜂群图

Origin将普通散点图升级为清晰的基因分组差异蜂群图

蜂群图主要用于展示单一变量或多个变量的分布情况。它通过在图表中沿着某个轴上均匀分布数据点,避免它们重叠,以清晰呈现数据的分布密度和趋势。

                             

相比于普通散点图,它拥有以下一些优势:

1)分布展示:

蜂群图适用于展示大量数据点的分布情况,特别是在数据密集的区域,可以更好地揭示数据的聚集和分散趋势。

2)避免重叠:

通过沿轴均匀排列数据点,蜂群图通过智能排列点来有效地解决了散点图中可能出现的重叠问题,提高了数据点的可读性。

3)适用于分组分类数据:

蜂群图通常用于展示分类数据的分布情况,例如对比不同组别或类别之间的数据分布。

4)显示密度,保留精确值:

点的密集程度反映数据的分布密度,通过观察蜂群图中的点的分布情况,可以直观地了解数据的集中趋势、离散度和异常值。

5)美观和易解释:

蜂群图在图形上是简洁而美观的,易于解释。数据点的分布清晰可见,使观察者能够迅速理解数据的特征。

与类似图表的比较

小提琴图:显示分布形状但丢失个体数据点

箱线图:只显示五数概括(最小值、Q1、中位数、Q3、最大值)

散点图:简单但容易重叠

蜂群图主要适用场景

(1)中小规模数据集(通常n<1000);(2)需要同时显示分布形状和个体数据点时;(3)比较多个组的分布情况。

本期教程使用Origin绘制基因分组差异图。

1.打开Origin软件,把数据输入进来;

2.选中所有的数据,点击绘图—统计图—蜂群图;

3.绘制出来的图形如下图所示,接着需要对其进行细节美化;

4.单击数据点,在跳出的浮动工具中,选择减少数据点。

5.双击图形,在组对话框下,符号边缘颜色设置成自己喜欢的颜色;

6.双击坐标轴,在刻度对话框下,对坐标轴的范围进行修改;

7.接着对图形进行其他细节美化,包括修改图例、添加边框、修改字体、修改纵坐标标题等,其最终效果图如下图所示:

以上就是Origin绘制蜂群图的基本步骤,根据以上步骤即可绘制清晰的基因分组差异蜂群图。蜂群图特别适合展示数据分布的同时保留所有数据点信息,是探索性数据分析中的有用工具。大家快去试试吧!

——END——

HAPPY EVERDAY!

### 如何在Origin中创建分组散点图 #### 数据准备 确保数据已经准备好,通常情况下,数据会包含多个列,其中至少有一列为分类变量用于定义不同组别。例如,在汽车性能分析中,“加速时间”作为X轴,“每加仑英里数(MPG)”作为Y轴,“产地(Origin)”作为分组依据。 #### 导入数据 启动Origin软件后,通过文件菜单中的`Import`选项导入外部数据文件,支持多种常见格式如Excel、CSV等。对于已有内置示例数据集的情况,则可以直接加载特定的数据表[^1]。 #### 创建基础散点图 选择菜单栏上的`Plot` -> `Symbol` -> `Scatter`来生成基本的二维散点图形。此时将会弹出对话框提示选择要绘制成散点图的数据范围;按照需求指定相应的XY坐标列以及分组字段。 #### 设置分组形样式 完成初步绘之后,可以通过双击表内部打开属性编辑器进一步自定义外观。针对每一个独立的子群(即由“Origin”划分的不同国家),可以单独调整其标记形状、大小及颜色等视觉特征。具体操作是在右侧的层管理面板找到对应的系列名称,点击进入细节配置页面进行修改。 ```matlab % 假设h为返回的对象数组,jgroup指向第三个分组对象 jgroup = h(3); jgroup.Color = 'k'; ``` 上述MATLAB代码片段展示了如何改变某一特定分组的颜色至黑色,这一步骤同样适用于其他任何合法的颜色值或预定义色彩常量。 #### 添加辅助元素 为了增强可读性和美观度,还可以考虑增加趋势线、误差棒等功能性组件。这些都可以借助于工具条上提供的快捷按钮实现,或是右键单击目标位置选取相应命令执行。
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