2.R实现影像组学数据分析

最新推荐文章于 2024-04-23 17:10:40 发布
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分类专栏： 影像组学_R 文章标签： r语言 数据分析 经验分享
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版权

一、R语言概述

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二、R语言特点

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三、R安装

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四、R基础上安装Rstudio

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五、R语言基础

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六、R实现论文数据分析方法

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6.1 R进行基于lasso的数据变量选择（降维）

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6.2、R实现Logistic 回归

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6.3 构建模型

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6.4 结果分析

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七、机器学习算法——随机森林

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八、R实现随机森林算法在这里插入图片描述

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专栏目录
【影像组学导论】Radiomics实现之R语言入门！
挺烦先森
08-19 2148
以下是本文内容： 一、引语 二、R&Rstuio简介 三、Rstudio优势 四、R软件下载与安装 五、Rstudio下载与安装 六、Rstudio窗口调试 一、引语 在“导论”的前一篇中，我们提到了国内前者学者2018年经典影像组学JCO(IF = 32.956!)文章《Development and Validation of a Radiomics Nomogram for Preoperative Prediction of Lymph Node Metastasis
人工智能在医学影像组学中的应用.pdf
07-10
人工智能在医学影像组学中的应用.pdf
基于MATLAB的医学影像数据迁移学习的实现.pdf
04-20
基于MATLAB的医学影像数据迁移学习的实现.pdf
影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料
06-15
影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料 资源目录和介绍：https://blog.csdn.net/u011321546/article/details/117929452 影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料 影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料 影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料 影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料 影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料 影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料 影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料 影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料 影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料 影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料 影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料 影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料 影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料 影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料 影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料 影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料 影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料 影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料 影像组学与人工智能零基础入门课程视频资料
Params.zip_影像组学_影像组学参数
07-15
影像组学参数设置,包括文件类型，提取特征设置，参数设置
R语言机器学习之影像组学分析的原理详解
Rocky006的博客
07-23 2011
影像组学从常规医学图像中高通量提取大量的放射学定量数据，并以非侵入性方式探索它们与临床结果的相关性，在医学研究中得到广泛的应用。影像组学（Radiomics）和机器学习技术结合是AI影像辅助诊断的常用方法。影像组学研究的一般步骤如下：从CT、PET或MRI等医学图像中高通量地提取并分析影像学特征，而后基于图像分割、提取筛选特征、构建预测模型等机器学习算法来实现疾病的诊断、评估、预测等临床应用。 即，获取图像、勾画感兴趣区（Region of interset, ROI）、从 ROI中提取定量特征及降维、筛选
医学影像组学数据特征值介绍
Coder_LCB的博客
05-31 9933
在和临床一线医生合作中，遇到的最大问题就是： 1.影像组学中的特征值是什么含义？ 2.如何对应到临床信息，这个课题应该计算哪些特征值？ 3.如何验证这些特征值是正确的？ 最新的pyradiomics可以计算的特征值包括以下几类： Radiomic Features This section contains the definitions of the various features...
影像组学|影像组学导论
xiaoheijiayoubbs的博客
02-12 1313
影像组学导论
实现影像组学全流程
热门推荐
weixin_42990106的博客
12-23 1万+
需要完整代码到这里https://aistudio.baidu.com/aistudio/projectdetail/3270880 fork项目之后下载glioma.7z压缩包，然后用RStudio的RMarkdown进行运行 1.项目介绍 2012年荷兰学者提出影像组学(radiomics）概念：借助计算机，从医学影像中挖掘海量定量影像特征，使用统计学/机器学习方法，筛选出最有价值的影像学特征，用来解析临床信息。 可以说影像组学是人工智能在医学领域的一种特定研究方式。 做影像组学一般会经过以下步骤1
用R语言用生存资料做基于radiomic（影像组学）的生存分析
我的灯还亮着的博客
07-27 9512
最近写好了一篇肿瘤二区SCI，具体就不透露了，来跟大家分享一下经验，觉得好的可以留言哈。本文内不懂得可以留言我们一起讨论，很多词在 前面的文章中已经写了。 要想做基于影像组学的生存分析，肯定是离不开和医院的合作，因为你要拿数据啊，医院出数据，你提供算法，俩人共同第一作者……下面以预测某癌症手术后的复发为目的，按处理顺序来讲一下这个大概是要怎么做。（这里生存终点是指复发，生存时间是治疗开始到复发...
影像组学特征提取GUI部分代码（包含部分实验图片）_matlab GUI_影像组学
09-22
改代码适用于做影像组学特征提取相关工作的科研人员，可作为启示
Slicer安装包（用于放射组学特征提取等）
09-29
Slicer是一款常用于MR等临床数据分析的工具，可以在内部配置python程序，如常用于放射组学提取特征的pyradiomics。
张俊华 医疗影像的大数据分析和管理.zip
03-25
张俊华撰写的《医疗影像的大数据分析和管理》是一个针对当前医疗行业面临的数据增长挑战而设计的大数据解决方案文档。在这份文档中，张俊华深入探讨了如何通过高效的大数据分析工具和技术，提升医疗影像数据的处理...
影像组学介绍
Alexa_的博客
01-13 999
其实就是想把图像处理领域的知识点，应用到医学图像里面。当初影像组学方法是，现在人工智能方法也是。随着精准定量医学影像技术的快速发展、图像识别技术和数据算法的不断更新，医学图像大数据的挖掘和分析得以实现，极大程度扩展了医学图像的信息量。基于对图像信息进行纹理分析后能够得到高通量的特征的特点，受基因组学以及肿瘤异质性的启发，2012年荷兰学者Lambin在先前学者工作的基础上提出了**影像组学(Radiomics) **的概念[1]。
临床特征 + 影像组学 特征筛选 并 利用逻辑回归进行二分类
Sweety_Lin的博客
11-23 4320
任务描述：临床特征 和 影像组学特征 保存在 excel 文件中，需要进行 特征筛选，然后再将筛选出来的特征利用逻辑回归进行二分类。 有如下几个问题和需求： 1. excel 中的特征都是以 str 的形式写入表格中的，读取的时候要转换成数字形式；特征之间的尺度不一样，读取出来之后需要按列进行归一化； 2. excel 中保存的标签为符号格式：IA, MIA, AAH,...
R语言-影像组学数据处理
dr_yingli的博客
08-12 4265
使用R语言对影像组学数据进行处理 测试数据 library(caret);library(glmnet);library(pROC) set.seed(123456) data <- read.csv("data.csv", header = T) p.data <- preProcess(data[,-1],method = c("center","scale","corr")) P.data <- predict(p.data,newdata = data[,-1]) lass
【影像组学】从特征筛选到分类建模全流程实践及作图
abdslfwoeugp
06-19 7644
1. 数据准备 2. 特征权重图 3. 特征相关性热度图 heatmap 4. LASSO 模型中 Lambda 选值图 5. 特征系数随 Lambda 变化曲线 6. 随机森林分类器 7. ROC 曲线 8. 精确度（Precision），敏感度（Sensitivity），特异度（Specificity）等输出......
影像组学之数据分析模型测试服务 500
weixin_43750722的博客
04-18 1040
结果呈现 1、你的任务 整理好数据，生成对应的文件夹 2、可测试的深度学习模型（最多选三种） 3、结果呈现 提取的深度学习特征 训练超参 交叉验证箱型图 各模型柱状图及曲线 Roc曲线 混淆矩阵 列线图 生存分析 ......等论文物料图和详细的技术路径实现 分析服务包含 三种模型跑出来的结果图：ROC,,混淆矩阵，相关性图表，列线图等 相应的升级优化建议 注：跑出来的结果是什么样就是...
R语言 数据的整理与清洗（Factor篇）
最新发布
yangyulu1998的博客
04-23 662
但此时的顺序只是为了方便（钢笔、铅笔、画笔）–它将决定例如输出将如何打印，或图形的排列。导入数据后，您可能会有一个包含因子和其他类型向量的数据框，并希望重新计算所有因子的。R中的因子有两种：有序和无序，例如，{小，中，大}和{钢笔，刷子，铅笔}。这可能发生在数据导入过程中，也可能发生在删除某些行时。也可以使用R的字符串搜索和替换函数来重命名因子的。对于大多数分析，因子是有序的还是无序的并不重要。如果有任何一个不在列表中，它们将被替换为。更改水平顺序的一种方法是在因子上使用。1、如果因子是有序的，那么。
影像组学与转录组学联合分析一般分析流程
05-30
影像组学和转录组学联合分析的一般分析流程如下： 1. 数据预处理：影像组学分析需要对图像进行预处理，如图像去噪、图像配准、分割等；转录组学分析需要对测序数据进行质控、去除接头序列、过滤低质量序列等处理。 2. 特征提取：从预处理后的影像或测序数据中提取特征，如影像组学中可提取形态学、纹理、功能等特征；转录组学中可提取基因表达量、基因差异表达等特征。 3. 数据集成：将影像组学和转录组学的特征进行集成，形成一个综合特征矩阵。 4. 统计分析：采用统计学方法对综合特征矩阵进行分析，如聚类分析、主成分分析、差异分析等。 5. 生物信息学分析：对统计分析得到的结果进行生物信息学分析，如基因富集分析、通路分析、功能注释等。 6. 结果解释：根据生物信息学分析的结果，解释影像组学和转录组学的联合分析结果，发现相关生物学机制和生物标志物。 需要注意的是，影像组学和转录组学联合分析需要专业的技术和领域知识，以及大量的数据处理和分析工作。

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