R语言：如何安装包“linkET”

最新推荐文章于 2024-06-24 09:41:36 发布

HHXX好好学习

最新推荐文章于 2024-06-24 09:41:36 发布

阅读量2.8k

点赞数 13

文章标签： r语言前端 vue.js

本文链接：https://blog.csdn.net/xzy123138/article/details/135982787

版权

博客内容主要展示了在R语言中进行包安装的操作。通过install.packages函数安装了usethis和devtools包，还使用devtools的install_github函数从GitHub安装了linkET库。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

install.packages("usethis")

library(usethis)

install.packages("devtools")

library(devtools)

devtools::install_github("Hy4m/linkET", force = TRUE)

确定要放弃本次机会？

福利倒计时

: :

立减 ¥

普通VIP年卡可用

立即使用

HHXX好好学习

关注关注

13
点赞
踩
16

收藏

觉得还不错? 一键收藏
1
评论
分享

复制链接

分享到 QQ

分享到新浪微博

扫一扫
举报

举报

科研绘图系列：R语言mantel_test结果可视化

专注生信领域

07-17

2252

科研绘图系列：R语言mantel_test结果可视化

相关性网络热图 / linkET包 / Mantel test

Xingchen0101的博客

12-17

6733

R实用绘图系列主要是带领大家绘制一些实用、好看而又不太复杂的科研常用图形，主打一个实用，该系列会持续更新，有需要的小伙伴赶紧关注起来吧。

1 条评论您还未登录，请先登录后发表或查看评论

linkET | 完美解决ggcor安装失败方案（附教程） Science神图

m0_72224305的博客

08-07

9514

linkET | 完美解决ggcor安装失败方案（附教程）

R统计绘图-环境因子相关性+mantel检验组合图(linkET包介绍1)

qq_39859424的博客

06-01

4010

R语言数据处理学习记录--使用linkET包完成mental test

qq_22658373的博客

03-27

5620

linkET和ggcor基本上可以说是同根同源的包，且他们能实现的功能并不只有mantal test ，包括一些热图什么的都可以画，大家有兴趣的可以去作者的GitHub主页或者gitee上，gitee上也有拉取的数据库，能够看到源码和实现的效果。

R语言linkET包绘制相关性组合网络热图

dege857的博客

08-04

4992

能绘制热图的R包很多，既往我们已经介绍了《R语言pheatmap包绘制热图》，今天咱们来介绍一下R语言linkET包绘制相关性组合网络热图。相关性热图的意思热图和其他数据的关联性，比较的是多数据间的内在关系。下面咱们来进行相关性的网络热图绘制，绘制前要进行一个曼特尔试验，R包作者是这样说的，相异矩阵的Mantel和偏Mantel检验。linkET包是我们的一个国人写的，目前需要使用devtools::install_github下载，作者对包的描述是万物皆可互联，还挺有意思的。这里选3，不更新就可以了。

基于R的linkET包qcorrplot可视化Mantel test相关性网络热图分析correlation heatmap

twocanis的博客

09-26

7392

需求是对瘤胃宏基因组结果鉴定到的差异菌株与表观指标、瘤胃代谢组、血清代谢组、牛奶代谢组中有差异的部分进行关联分析，效果图如下：逗号分隔的csv格式文件，两个表格，一个是每个样本对应的表观指标数据，另一个是每个样本对应的菌群丰度，我这里用的是genus水平如果报错R版本有问题装不上（我的4.3.1版本R出现了这个报错）请尝试：

library(linkET)，如何利用R装linkET包

12-05

`linkET`是一个用于估计岭回归模型（Regularized Least Squares,RLS）的R语言包。如果你想要在R中安装这个包，可以按照以下步骤操作： 1. **打开R环境**：首先确保你已经启动了R软件。 2. **检查已有的包**：运行...

linket

最新发布

03-19

### linkET R包的技术概述 `linkET` 是一款专注于数据可视化的R包，主要功能在于通过 `ggplot2` 框架生成高质量的矩阵热图[^1]。尽管早期版本曾包含网络分析的功能模块，但为了更清晰的功能划分，这部分内容已被...

Links目录安装

yanghaizi123的专栏

09-27

291

在安装目录eclipse下新建一个language文件夹，在language下建立一个eclipse文件夹放插件 D:\eclipse\language\eclipse下放插件 D:\eclipse\links language.start.txt path=D:\\eclipse\\language...

探索数据之美：linkET——高效矩阵热图可视化工具

gitblog_00060的博客

06-24

718

探索数据之美：linkET——高效矩阵热图可视化工具去发现同类优质开源项目:https://gitcode.com/ 在数据分析与研究的世界里，将复杂的数据以直观的形式展现出来是至关重要的一步。今天，我们要向大家隆重介绍一个专注于简化热图可视化的强大工具——linkET。这是一个基于ggplot2构建的R语言包，旨在帮助研究人员和数据分析师们迅速而直观地展示矩阵数据。项目介绍 linkET是一...

绘制mantel test图新包linkET

刘永鑫的博客——宏基因组公众号

06-15

6950

安装和更新近期断断续续对linkET做了一些更新，主体是从方便用户使用，增强灵活性的角度出发的，至于我想在新版本中添加的功能，暂时还未完成，而且预计新功能完成可能得到端午节前后，所以这个版本（0.0.3）是未来一段时间比较稳定的版本，若是想尝新，不妨更新一下试试。## install.packages("devtools") devtools::install_githu...

linkET，环境因子相关性 + mantel test 可视化新选择

生信学习

05-29

6763

文章目录前言linkET 安装官方示例数据预处理热图Mantel test网络总结前言环境因子相关性 + mantel test 组合图，网上的可视化教程都是用R package：ggcor，但是好像没人维护了，安装起来也有一些小问题…… 最近发现有另一个package：linkET，同一个作者，熟悉的味道，这里简单安利一下。下面的内容都可以从大佬的Github上找到：https://github.com/Hy4m/linkET linkET 安装 # install.packages("devt

ggcor替代包：linkET，相关图，mantel test可视化

医学和生信笔记的博客

09-15

5056

本文首发于公众号：医学和生信笔记 “ 医学和生信笔记，专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。主要分享R语言做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。在几年前出现了一个ggcor包，可以用来可视化mantel test的结果，最开始还可以通过cran安装，不过后来也不行了，而且这个包由于一些原因已经停止维护了，最近的更新是2年前了！但是那张图却一直很风靡。。。其实原作者已经开发了新的包用于可视化mantel test，名字叫linkET，只是由于缺少宣

跟着iMeta学做图｜ggplot2绘制相关性分析线面组合热图

悟道西方

02-08

1968

本文代码已经上传至https://github.com/iMetaScience/iMetaPlot230118corr 如果你使用本代码，请引用：Changchao Li. 2023. Destabilized microbial networks with distinct performances of abundant and rare biospheres in maintaining ...

R包安装教程 | 熟悉的配方但不一样的味道

m0_72224305的博客

09-21

4529

1写在前面本期介绍一下R语言基础部分，R包的安装。🧐 大家肯定都觉得很简单，但往往简单的东西会有不一样的解决方案。来See~ See~ 吧！😘 2基础安装我们最常使用的就是install.packages()函数，来安装CRAN上的R包。我们可以选择将单个包作为变量传输进入，也可以通过向量的形式进行多个R包的安装。 2.1 安装单个R包 install.packages("tidyverse")install.packages("ggstatsplot")install.packages("ggV