相关性网络热图 / linkET包 / Mantel test

R实用绘图系列主要是带领大家绘制一些实用、好看而又不太复杂的科研常用图形，主打一个实用，该系列会持续更新，有需要的小伙伴赶紧关注起来吧。

预备知识

今天带领大家绘制的是相关性热图与网络图的组合图。

Mantel test相关性检验

我们首先通过一个具体的实例来理解Mantel test。有两个数据集varechem和varespec，如图所示。

varechem数据包含了24个土壤样本（行）的14项土壤理化性质信息（列）。varespec数据包含了24个土壤样本（行）的44个物种（列）的丰度信息。

假设44个物种可以被划分4个大类，制作成4个矩阵分别是Spec01、Spec02、Spec03、Spec04。普通的相关系数分析只能够判断两列数据之间的相关性，比如整个varechem数据中各列两两之间的相关性，或者varechem数据中的某列与varespec数据中某列之间的相关性。

如果我们想要分析varechem数据中的某列与整个Spec01数据（每个物种是一列，有多列）的相关性，那普通的相关分析方法就无用武之地啦。这个时候就要用到Mantel test方法了。

Mantel test不仅可以用于分析一列数据与一个矩阵数据之间的相关性，还可以分析一个矩阵数据与另一个矩阵数据之间的相关性。

Mantel test具体原理：

1. 数据准备：首先，有两个数据矩阵，它们代表了你想要比较的两组数据。这些矩阵可以是任何类型的，比如距离矩阵、相关系数矩阵等。
2. 计算距离或相似性：如果矩阵中的数据不是距离或相似性数据，需要将其转换为距离或相似性矩阵。这一步是将原始数据转化为适合Mantel te