rmast2sashimiplot安装攻略

rmats2sashimiplot是适配可变剪切rmats工具的作图软件，它的安装超级容易就成功的呢！比rmats简单好多好多，鸭鸭给大家分享一下我的安装过程。

以下是原作者指出所需要安装的依赖

这个工具是非常好安装嗒，鸭鸭是专门建了一个python 2.7的环境来安装相关依赖，然后成功跑通程序的！具体步骤如下喔:

1. 创建conda环境

conda create -n rmats2sashimi python=2.7

2. 安装python相关的包

pip install numpy
pip install scipy
pip install matplotlib
pip install pysam

3. 安装samtools

conda install -c bioconda samtools

4. 安装bedtools

conda install -c bioconda bedtools

5. 安装rmats2sashimiplot。需要先去作者github下载包（https://github.com/Xinglab/rmats2sashimiplot），解压后其实就可以直接运行。当然安装一下也可以，进入解压好的文件，命令行运行下面的setup就可以啦。

python ./setup.py install

以上全部安装好后就可以愉快地出图啦~

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