稳定同位素标记谱图可作为另一维数据
准确的质量分析是确定分子式的关键。目前,质谱仪准确度有了显著提高,使得质量准确度可达0.1mDa;但是要确定未知代谢物的分子式,仅靠准确度是不够的。在m/z不超过1500的小分子中,至少会有几个候选分子式。在超高分辨率分析中,精确分子量和同位素峰簇同时被用于确定分子式。在中分辨分析(如使用四杆飞行时间质谱)中,同位素峰簇因为没有被分离而难以被利用。这些事实表明,在中分辨分析中还需要其他的定性条件。
稳定同位素标记被用于阐明生物化学和天然产物化学中的结构。生物体可以从含有稳定同位素标记的中间体获得部分或全部标记的代谢物。NMR分析对比标记代谢物的谱图和非标记代谢物的谱图可以准确地进行结构解析。例如,在13C NMR中,非标记代谢物的化学位移和13C标记代谢物的耦合常数代表碳链的连接方式。
由于稳定同位素对生物体内特定代谢物的产生没有显著影响,同位素标记可应用于基于MS的植物代谢组学。例如,13CO2被广泛用来标记植物,然后比较未标记和标记的质谱图,以确定m/z值的变化(图2)。根据一级或MS/MS的分析结果计算确定每个原子的数量。利用得到的原子数,结合质量精度和同位素峰簇,可以从一系列可能的候选分子中归属得到代谢物的分子式。对于拟南芥样品,使用13C、15N和34S标记得到的代谢物的质谱图分析,可以明确代谢物的分子式。
图2 使用LC–MS/MS和稳定同位素标记的代谢组学示例。
代谢组学数据来源于稳定同位素标记和非标记的植物。稳定同位素标记的代谢物和未标记的代谢物在几乎相同的保留时间内被检测到;但是,由于标记的原因,它们的质量不同。质量位移差值代表了用稳定同位素标记的原子数。标记不仅揭示了前体离子的原子数,也揭示了产物离子的原子数。原子数的确定有助于探究它们的结构。在之前的报道中,用13C标记表征S-1-丙烯基巯基还原型谷胱甘肽的结构。