Windons10安装RDKit

起因

因为参加“英特尔杯”第一届中国研究生人工智能创新大赛，在机器学习进行新药研发领域了解到RDKit，使用官网提供的安装方式第一次并没有成功，在搜索很多相关资料后最后尝试一种方法，安装成功。

过程

1.官网方法

首先计算机需提前安装了Anaconda，打开Anaconda Prompt命令行窗口进行安装，一开始还行，但到了安装rdkit时报错。

conda create -c rdkit -n my-rdkit-env rdkit
注：加一个-c表示从http://anaconda.org下载资源包，conda create -n env_name 代表创建一个名字为env_name的虚拟环境；

运行截图：


然后搜索相关错误，解决办法一：
一般出错都是由于网络问题，失败就重新安装。注意！！我之前出错后只删除my-rdkit-env文件夹，然后即使显示安装成功了也不能用。正确做法是在anaconda的安装路径中搜索rdkit，将所有相关文件全部删除，然后重新安装。解决办法出处：python包 —rdkit 安装，但是我并没有找到my-rdkit-env文件夹，只能换种方式安装。
解决办法二：
用anaconda原网站，下载速度慢，改用清华镜像网站，速度快。执行代码：

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --set show_channel_urls yes
注：conda config --add channels 为添加镜像命令

解决办法出处：2019.3.26-无法使用conda安装RDKIT 。但仍有问题。

2.本地下载安装

首先下载：

https://github.com/rdkit/rdkit/releases

安装一条语句：

pip install xxx.tar.gz/xxx.whl

3.conda-forge安装

conda-forge这是一个组织，维护了可供使用的conda recipes，字面上理解是菜谱，就是一份相互关联的可打包在一起的东西。具体使用起来，就是推荐红色圈中的命令，首先加上conda-forge，然后安装所需要的工具包。这是最推荐的安装包的方式，因为是社团首选的一个可以使用的包，版本关联性等都是经过测试的。引自：CONDA-FORGE简介

conda install -c conda-forge rdkit

运行截图：

结局

引入成功

调用rdkit包，并使用函数绘制分子结构，jupyter notebook运行成功。