fastp软件 :rawdata生成cleandata

fastp软件快速将FASTQ文件自动化质控+过滤+校正+预处理

直接讲如何使用:

fastp -l 50 -w 10 -i ninanjie_1.fq.gz -I ninanjie_2.fq.gz -o ninanjie_clean.1.fq.gz -O ninanjie.2.fq.gz --json ninanjie.json --html ninanjie.html

#fastp 软件

-i 后接read1.fq.gz

 -I 大写 i 后接read1.fq.gz

-o 后接输出的clean.1.fq.gz

-O 后接输出的clean.2.fq.gz

--json 生成的json文件

 --html 生成的html文件

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