fastp软件快速将FASTQ文件自动化质控+过滤+校正+预处理
直接讲如何使用:
fastp -l 50 -w 10 -i ninanjie_1.fq.gz -I ninanjie_2.fq.gz -o ninanjie_clean.1.fq.gz -O ninanjie.2.fq.gz --json ninanjie.json --html ninanjie.html
#fastp 软件
-i 后接read1.fq.gz
-I 大写 i 后接read1.fq.gz
-o 后接输出的clean.1.fq.gz
-O 后接输出的clean.2.fq.gz
--json 生成的json文件
--html 生成的html文件