NCBI下载整个界面和只下载序列的方法

最新推荐文章于 2024-10-21 08:00:00 发布
最新推荐文章于 2024-10-21 08:00:00 发布
阅读量1k 收藏 8
点赞数 12
文章标签： 经验分享 笔记
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/zs18242304295/article/details/135771718
版权
本文介绍了如何根据生物序列的拉丁名或编号（如NC_018119.1）在特定界面中搜索并下载对应文件的过程，提供了一种技术性的操作方法。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

 方法：

根据要下载的内容，搜索对应的名称（拉丁名）或者编号（比如 NC_018119.1），然后就可以进入到下面的界面，就根据图片的提示下载对应的文件即可。

是三姨呀
关注
几种在NCBI中查询获取目的基因序列的方法
qq_23435961的博客
01-12 1万+
几种在NCBI中查询获取目的基因序列的方法 在NCBI中，如何查询并下载获得某物种的某特定功能的基因序列，相信对于看到此篇的大部分同学来说都不陌生了。想到对于刚开始接触生信的同学们来说，也许尚不能很熟练地在NCBI中查询想要的基因序列，因此在这里简要作了一个总结，希望对初学生信的同学们有所帮助。 此篇博文源于此前有同学问我，提到他导师给他布置任务，查找相关的文献，看相关文献中都报道了哪些细菌物种能够产生聚羟基脂肪酸酯（polyhydroxyalkanoate ，PHA），参与合成该产物的基因都有哪些，然后在
下载blast数据库和可执行文件
weixin_39417324的博客
12-04 1347
今天踩到了一个坑，下载blast数据库和可执行文件遇到的，当然，这个可能对很多人来说不是难事，但是我还是粘出来吧，希望对大家有帮助 blast官网： https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 然后点击这个下载blast，如果大家找不到，或者不认识单词，那么不要紧，链接赶紧粘下： https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastDocs&DOC_TYPE=Download
NCBI批量下载序列
hgz2020的博客
08-16 933
NCBI
如何从NCBI上的Gene数据库批量下载基因序列数据
qq_65680034的博客
03-01 1万+
昨天先尝试了python脚本，为了保险起见，先编写了下载一个基因的压缩包数据，后续批量下载只需改一下ID的提供。但是比较有趣的是与官网直接手动下载相比，我编的程序下载的数据刚刚好缺了我最想要的gene.fna数据，也就是做了大半天无用功，真是drama哈哈哈。实现，但是通过Gene和Nucleotide数据库进行检索得到的结果不同，即Gene数据库检索结果不能直接得到fasta序列，它需要手动点击Download Datasets键获得基因数据压缩包，里面包含基因的fasta序列gene.fna文件。
NCBI上测序数据的下载
weixin_55372631的博客
05-12 1489
在生信分析中，由于论文中提供的数据有限，很多时候需要自己下载论文中的测序数据重新进行分析，从而得到自己想要的数据。而论文中的作者往往会把测序数据上传到NCBI中。因此学会如何从NCBI下载测序数据非常重要。
NCBI 数据下载
小猪打呼噜
04-12 1475
网上介绍的那几种直接下载NCBI数据的方法大都下载速度很慢，但是EBI (European Bioinformatics Institute) 下载很快，而且它的数据库和NCBI是共享的，所以我们可以直接从 EBI 下载。1 、 确定要下载的 SRA 编号；
NCBI数据下载的几种方法
ma1239631998的博客
01-09 1万+
批量下载Genbank中的数据
NCBI大规模序列下载器：简化海量数据获取工具
该软件的核心功能是方便用户从NCBI数据库下载大量的基因组、蛋白质或其他生物序列数据，支持Python编程语言（兼容Python 2和Python 3），并且采用PyQt5构建图形用户界面（GUI），允许用户在图形化界面或命令行模式下...
从NCBI批量下载数据
qq_50637636的博客
03-13 3497
NCBI下载文献中提到的数据时，都会遇到数据较多，下载较慢的问题，本文提供了一个shell脚本可以批量化下载数据，提高工作效率。比如说，有一个Project号为PRJNA229998，GEO号为GSE52778的项目（转录组数据既有Project号也有GEO号，两者对应的同一个项目），该项目测了哮喘病人服用两种药后气道平滑肌的转录组，网址为，我想要下载服用Alb这种药和对照组为服药的转录组数据，大体分为三步走，一是拿到SRA号，二是筛选想要的SRA号，三是下载。
NCBI在线BLAST使用方法与结果详解.pdf
10-30
NCBI 在线 BLAST 使用方法与结果详解 NCBI 在线 BLAST 是一套在蛋白质数据库或 DNA 数据库中进行...通过了解 BLAST 的使用方法和结果的解释，可以更好地应用 BLAST 工具来进行序列相似性分析，提高研究效率和准确性。
NCBI教程：大鼠CTGF基因序列查找与GenBank格式下载
本教程详细讲解了如何通过NCBI的MapViewer功能查找和分析基因序列，特别是以大鼠（Rattus norvegicus）的结缔组织生长因子（CTGF）为例进行操作。 首先，访问NCBI MapViewer的主页(<http://www.ncbi.nlm.nih.gov/...
转载：教程：在NCBI批量Blast
热门推荐
GRC
02-23 1万+
本文全文转载子云生物：http://yunbio.com/49 先要多谢一下 Sophie 与 rebeccajiejie 的热心，让 云生物 看起来着实有些了活力。也希望更加的人参与进来回答问题。得开始认真宣传一下才行啊。 最近Sophie问了我关于批量Blast的问题。我尝试了一下NCBI的批量Blast，感觉非常不错。 写个教程分享一下。拿水稻的序列Blast做个例子。
利用 eutils 实现自动下载序列文件（python实现）
Bio大恐龙
09-19 1610
eutils下载序列文件 eutils介绍 requests库的简单使用 生物信息
如何下载NCBI中的测序数据
最新发布
大甘的博客
10-21 2246
PRJNA号是与SRP号类似的BioProject编号，但PRJNA可以跨数据库使用，包括基因组数据、RNA-Seq、和基因表达等不同类型的数据。enter键进入chose, 选择一个默认的数据下载具体路径，到时候程序命令下载如果不指定输出路径，就会默认输出到这个路径。：SRP号通常对应于一个研究者提交的整体项目，用来描述一个研究计划的背景和目的。指向一个已提交的归档条目，通常是BioProject、实验、运行等信息的集合。：GSE号描述了一个GEO研究项目中的实验设计，并将相关样品和数据进行分组。
从blast数据库中批量下载-Aspera
li1guangjun的博客
02-25 1090
最近需要下载blast数据库，用wget几十K太慢了，网上搜索后发现有一个数据告诉下载工具Aspera官方网站 参考两篇知乎上两篇文章：Aspera参考1、Aspera参考2 在Linux我习惯首先用conda，如果没有conda安装，再考虑安装源码（conda实在太好用了） (base) [user@localhost blast]$ conda install -y -c hcc aspera-cli Collecting package metadata (current_repodata.json)
ncbi-genome-download批量下载基因组数据
hgz2020的博客
10-11 8605
ncbi-genome-download
在NCBI SRA 下载序列文件
weixin_42384601的博客
06-25 463
复制代码到文本中，修改创建的路径信息和软件安装位置信息，文件后缀为[.bat] 文件、双击运行即可。SRA地址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/
从NCBI上快速下载目标物种基因组序列、获取SRA数据信息
m0_55059521的博客
05-04 1万+
从NCBI上快速下载目标物种基因组序列、获取SRA数据信息
生信项目之NCBI下载数据集详解
weixin_44540733的博客
03-10 8861
NCBI（National Center for Biotechnology Information）的中文名称是美国生物信息技术中心，该网站是美国医学图书馆（NLM）的一部分。该网站提供了下载数据集、上传数据集、在线分析数据集以及提供了部分生物信息学工具如（BLAST：一款序列比对工具）等功能。本文主要介绍如何在NCBI上下载数据集。这三种方法是目前比较常用的下载数据集的方法，当然还用其他很多下载数据集的方法，具体的下载数据集的方法要按照该生信项目的需求进行下载。
评论 1
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值