TCGA数据下载：R包TCGA2STAT介绍

上期介绍了若干种获取TCGA数据的方法，今天这期会落点于TCGA2STAT这个R包的介绍上，一步步的来说明下载方法，哪些数据是可以下载到的。

R包的下载

install.packages("TCGA2STAT")

选择如何的镜像，咱们在中国，就选择china，这样的话下载速度会很快，也容易安装R包成功。

可下载的数据

1、 RNASeq ，默认是count类型，是指下载raw read counts数据。可以改为RPKM，是指下载normalized read counts数据 (reads per
kilobase per million mapped reads)。

2、RNASeq2，是指来自the second pipeline的RNASeq基因数据。

3、miRNASeq，默认为count，是指下载raw read counts数据；可以改为rpmmm，是指下载normalized read counts。

4、Mutation，默认为smoatic，是指non-silent somatic mutations 数据；改为all，表示为all mutations数据。

5、Methylation，默认为来自p