TCGA数据下载：R包TCGAbiolinks介绍

最新推荐文章于 2024-09-16 12:34:16 发布

茁壮小草

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文章标签： TCGA

本文链接：https://blog.csdn.net/xxzhangx/article/details/52819785

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本文介绍了R包TCGAbiolinks的使用，该包用于下载TCGA数据，包括多种数据类型。建议在R环境下而非RStudio中进行下载，以获得更好的效果。参考TCGA2STAT数据介绍，并查阅TCGAbiolinks的官方文档以了解不同平台和数据类型的下载详情。通过实验操作来进一步理解和验证下载过程。

摘要由CSDN通过智能技术生成

昨天介绍了TCGA2STAT这个R包，今天来继续根据博文 TCGA数据下载方法简介中的顺序来介绍R包TCGAbiolinks包，其下载数据类型类似于TCGA2STAT，但是又比它难懂。

R包的下载

## try http:// if https:// URLs are not supported
source("https://bioc.ism.ac.jp/biocLite.R")
biocLite("TCGAbiolinks")

涉及的包很多，可能很久才能下载完，下载建议使用R，不要用Rstudio，效果更好。

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TCGA简易下载工具.zip

12-03

该工具可以简化TCGA数据库的下载步骤，合并TCGA数据库中下载的文件挺不错的一个资源，亲测可用，如果需要的话，就赶紧来下载吧!!

TCGA数据挖掘(全网最详细)

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