求助DESeq2安装问题

最新推荐文章于 2024-06-11 20:16:57 发布
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在R中尝试安装DESeq2包时遇到了路径不可写和包更新的问题，导致安装失败。首先安装了BiocManager，然后尝试安装DESeq2，虽然DESeq2的二进制包被下载并打开成功，但在更新其他依赖包如DelayedArray时出现了版本冲突。最终在RStudio中加载DESeq2时，报错找不到名为'KEGGREST'的包。寻求帮助解决R中DESeq2及其依赖包的安装问题。
摘要由CSDN通过智能技术生成

> if (!require("BiocManager", quietly = TRUE))
+     install.packages("BiocManager")
Bioconductor version 3.16 (BiocManager 1.30.19), R 4.2.2 (2022-10-31 ucrt)
> 
> BiocManager::install("DESeq2")
Bioconductor version 3.16 (BiocManager 1.30.19), R 4.2.2 (2022-10-31 ucrt)
Installation paths not writeable, unable to update packages
  path: C:/Program Files/R/R-4.2.2/library
  packages:
    boot, class, codetools, foreign, MASS, Matrix, nlme, spati

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