在R语言中，数据存储和读取是数据分析工作的重要环节，如何读取RDS或RData格式文件？

下面内容摘录自《用R探索医药数据科学》专栏文章的部分内容。栏目后续章节的文章将深入概括R语言在临床研究和新药创新领域的应用，填补了国内R教材中尚未广泛覆盖的部分内容。​​​​​​​2章7节：读写RDS，CSV，TXT，Excel，SPSS、SAS、Stata、Minitab等的数据文件（更新20240807）_r语言读取rds文件-CSDN博客文章浏览阅读481次。读写RDS或RData等不同格式的文件，包括CSV和TXT、Excel的常见文件格式，和SPSS、SAS、Stata、Minitab等统计软件的数据文件。_r语言读取rds文件https://blog.csdn.net/2301_79425796/article/details/140642745?csdn_share_tail=%7B%22type%22%3A%22blog%22%2C%22rType%22%3A%22article%22%2C%22rId%22%3A%22140642745%22%2C%22source%22%3A%222301_79425796%22%7D

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 一、RDS或RData格式文件

在R语言中，数据存储和读取是数据分析工作的重要环节。R提供了两种原生格式用于存储数据：RDS和RData格式。这两种格式在R语言环境中非常有用，因为它们能够高效地存储和读取数据，同时保持数据的完整性和特定结构。如果不考虑数据的可移植性，并且数据处理过程中只使用R，推荐直接使用这两种格式进行数据的读写操作。

RDS格式用于存储单个R对象，如数据框、列表或模型等。由于其采用二进制格式进行存储，RDS文件的大小通常较小，并且在读取时可以保留对象的完整结构和属性信息。

RDS格式的一个重要优势是可以在读取时将对象重新赋予不同的名称，这使得在同一R会话中处理多个版本的数据或模型变得更加灵活。尽管RDS文件在保存和读取过程中可能稍微慢一些，但其高效的存储方式和灵活的命名能力使其在数据科学中非常受欢迎。

下面是比较XLS（EXCEL）、CSV、RDS和RData格式的表格：

	XLS	CSV	RDS	RData
存储对象数量	多个工作表中的多个对象	单个数据集	单个对象	多个对象
是否保留原始结构和属性	是	否	是	是
文件大小	大	较大	小	较大
读取速度	较慢	较慢	快	快
灵活性	中	高	高	中
覆盖已有变量风险	否	否	否	是
压缩	否	否	是	否
常见使用软件	Excel, R, Python	Excel, R, Python	R	R

当数据处理过程完全依赖于R语言，并且不需要将数据传递到其他平台时，直接使用RDS或RData格式来读写数据是一个高效且可靠的选择。这两种格式不仅能够保证数据的紧凑性和读取速度，还能够完整地保留R特有的数据结构和属性信息，从而提高数据处理的效率和准确性。

先生成数据集 data_list ，它是一个包含多种数据类型的列表，具有三个主要部分：一个数据框 df，其中包含两列数据，一列是从1到5的整数，另一列是字母 a 到 e；一个数值向量 vec，包含五个数值；以及一个3x3的矩阵 matrix，其元素从1到9。这个数据集展示了R中不同数据结构的使用，包括数据框、向量和矩阵，适合用来进行各种数据处理和分析操作，如下面代码。

# 生成一组示例数据
data_list <- list(
  df = data.frame(a = 1:5, b = letters[1:5]),   # 创建一个数据框，包含两列
  vec = c(10, 20, 30, 40, 50),                  # 创建一个数值向量
  matrix = matrix(1:9, nrow = 3)                # 创建一个3x3的矩阵
)

# 将数据保存为RData格式
save(data_list, file = "data_list.RData")

# 将数据保存为RDS格式
saveRDS(data_list, file = "data_list.rds")

上面涉及几个函数，这个说明一下。

1） data.frame() 函数用于创建一个数据框，它是用于存储表格数据的基本数据结构。在代码中，我们用它创建了一个包含两列的数据框，其中一列包含整数，另一列包含字母。这个数据框被存储在一个列表 data_list中。

2）save() 函数用于将一个或多个R对象保存到RData格式的文件中。RData格式能够保存多个对象并保留其原始结构和属性。在代码中，我们使用 save() 函数将 data_list 列表保存为一个名为 data_list.RData 的文件，这样可以在以后恢复这个数据列表。

3）saveRDS() 函数用于将单个R对象保存为RDS格式的文件。RDS格式专为存储单个对象设计，并允许在读取时将对象赋予新的名称。在代码中，我们使用 saveRDS() 函数将 data_list 保存为名为 data_list.rds 的文件，这种格式适合于在需要时重新加载数据并为其指定不同的变量名。

然后读取数据

# 从RDS文件读取数据
data_list_rds <- readRDS("data_list.rds")
print("数据从RDS文件读取:")
print(data_list_rds)

在这段代码中，readRDS() 函数用于从名为 data_list.rds 的RDS文件中读取数据，并将其赋值给变量 data_list_rds。这个函数专门用于读取RDS格式的文件，能够恢复保存的单个R对象。随后，print() 函数被用来显示从RDS文件中读取的数据，以便用户检查和验证数据的内容。通过这些函数，用户可以方便地加载和查看之前保存的数据。

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在这里，你学到的并非仅仅是 R 的某一个技巧，而是能够从零开始，深入且系统地学习 R 语言。此外，本专栏每周至少定期更新三篇文章，每篇文章篇幅均在 5000 字以上。而且，对于已经发表的知识点，我们也会根据新的技术或理解及时进行更新，这是纸质版图书无法做到的。为了让更多的忠实粉丝和同学们享受到实惠，本专栏采用折扣定价策略。随着章节的不断完成，折扣力度会逐渐减小。所以，现在正是订阅的最佳时机！

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第一章：认识数据科学和R

1章1节：数据科学的发展历程，何 R 备受青睐及我们专栏的独特之处（更新20240822）-CSDN博客

1章2节：关于人工智能、机器学习、统计学连和机器学习、R 与 ChatGPT 的探究 (更新20240814)-CSDN博客

1章3节：R 语言的产生与发展轨迹（更新2024/08/14）-CSDN博客

1章4节：数据可视化， R 语言的静态绘图和 Shiny 的交互可视化演示（更新20240814）-CSDN博客

第二章：R的安装和数据读取

2章1节：R和RStudio的下载和安装（Windows 和 Mac）_rst语言选择哪个镜像-CSDN博客

2章2节：RStudio 四大区应用全解，兼谈 R 的代码规范与相关文件展示_rstudio的console和terminal-CSDN博客

2章3节：RStudio的高效使用技巧，自定义RStudio环境（更新20240823）_rstudio如何使用-CSDN博客

2章4节：用RStudio做项目管理，静态图和动态图的演示，感受ggplot2的魅力-CSDN博客

2章5节：认识和安装R的扩展包，什么是模糊搜索安装，工作目录和空间的区别与设置（更新20240807 ）-CSDN博客

2章6节：R的数据集读取和利用，如何高效地直接复制黏贴数据到R（更新20240807 ）_r语言 复制数据集-CSDN博客

2章7节：读写RDS，CSV，TXT，Excel，SPSS、SAS、Stata、Minitab等的数据文件（更新20240807）_r语言读取rds文件-CSDN博客

2章8节：一文学会 R Markdown 的文档核心操作，切记文末有R资源的分享_r markdown文件(.rmd)-CSDN博客

2章9节：认识R与数据库连接和网络爬虫，学会在R中使用SQL语言_sql和r语言-CSDN博客

2章10节：用 R 直接下载并分析 NHANES 数据库的数据，文末示例自创便捷下载函数（更新20240807）_nhanes数据分析-CSDN博客

第三章：认识数据

3章1节：数据的基本概念以及 R 中的数据结构、向量与矩阵的创建及运算-CSDN博客

3章2节：继续讲R的数据结构，数组、数据框和列表-CSDN博客

3章3节：R的赋值操作与算术运算_r里面的赋值-CSDN博客

3章4节：R的逻辑运算和矩阵运算-CSDN博客

3章5节：R 语言的循环与遍历函数全解析-CSDN博客

第四章：数据的预处理

4章1节：全面了解 R 中的数据预处理，通过 R 基本函数实施数据查阅_r数据预处理-CSDN博客

4章2节：从排序到分组和筛选，通过 R 的 dplyr 扩展包来操作-CSDN博客

4章3节：处理医学类原始数据的重要技巧，R语言中的宽长数据转换，tidyr包的使用指南-CSDN博客

4章4节：临床数据科学中如何用R来进行缺失值的处理_临床生存分析缺失值r语言-CSDN博客

4章5节：数据科学中的缺失值的处理，删除和填补的选择，K最近邻填补法-CSDN博客

4章6节：R的多重填补法中随机回归填补法的应用，MICE包的实际应用和统计与可视化评估-CSDN博客

4章7节：用R做数据重塑，数据去重和数据的匹配-CSDN博客

4章8节：用R做数据重塑，行列命名和数据类型转换-CSDN博客

4章9节：用R做数据重塑，增加变量和赋值修改，和mutate()函数的复杂用法_r语言如何在数据集中添加变量-CSDN博客

4章10节：用R做数据重塑，变体函数应用详解和可视化的数据预处理介绍-CSDN博客

4章11节：用R做数据重塑，数据的特征缩放和特征可视化-CSDN博客

4章12节：R语言中字符串的处理，正则表达式的基础要点和特殊字符-CSDN博客

4章13节：R语言中Stringr扩展包进行字符串的查阅、大小转换和排序-CSDN博客

4章14节：R语言中字符串的处理，提取替换，分割连接和填充插值_r语言替换字符串-CSDN博客

4章15节：字符串处理，提取匹配的相关操作扩展，和Stringr包不同函数的重点介绍和举例-CSDN博客

4章16节：R 语言中日期时间数据的关键处理要点_r语言 时刻数据-CSDN博客

第五章：定量数据的统计描述

5章1节：用R语言进行定量数据的统计描述，文末有众数的自定义函数-CSDN博客

5章2节：离散趋势的描述，文末1个简单函数同时搞定20个结果-CSDN博客

5章3节：在R语言中，从实际应用的角度认识假设检验-CSDN博客

5章4节：从R语言的角度认识正态分布与正态性检验-CSDN博客

5章5节：认识方差和方差齐性检验（三种方法全覆盖）-CSDN博客

5章6节：R语言中的t检验，独立样本的t检验-CSDN博客

5章7节：单样本t检验和配对t检验-CSDN博客

5章8节：方差分析（ANOVA）及其应用-CSDN博客

5章9节：组间差异的非参数检验，Wilcoxon秩和检验和Kruskal-Wallis检验-CSDN博客

第六章：定性数据的统计描述 

6章1节：定性数据的统计描述之列联表，文末有优势比计算介绍-CSDN博客

6章2节：认识birthwt数据集，EpiDisplay和Gmodels扩展包的应用-CSDN博客

6章3节：独立性检验，卡方检验，费希尔精确概率检验和Cochran-Mantel-Haenszel检验-CSDN博客

6章4节：相关关系和连续型变量的Pearson相关分析-CSDN博客​​​​​​​

6章5节：分类型变量的Spearman相关分析，偏相关分析和相关图分析-CSDN博客

6章6节：相关图的GGally扩展包，和制表的Tableone扩展包-CSDN博客​​​​​​​

第七章：R的传统绘图

​​​​​​​7章1节：认识R的传统绘图系统，深度解析plot()函数和par()函数的使用-CSDN博客

7章2节：R基础绘图之散点图、直方图和概率密度图-CSDN博客

7章3节：R基础绘图之条形图和堆积条形图-CSDN博客

7章4节：饼图，箱线图和克利夫兰点图-CSDN博客

7章5节：散点矩阵图，与小提琴图、Cleveland 点图、马赛克图和等高图-CSDN博客

7章6节：用R进行图形的保存与导出，详细的高级图形输出，一文囊括大多数保存的各种问题，和如何批量保存不同情况的图形-CSDN博客

 第八章：R的进阶绘图

8章1节：认识 ggplot2 扩展包，深度解析 qplot() 函数的使用-CSDN博客

 8章2节：深度讲解 ggplot2 的绘图步骤，理解其核心逻辑， 和 ggplot()函数-CSDN博客

 8章3节：用R来绘制医学地理图，文末有具体完整代码-CSDN博客

 8章4节：维恩图的认识与应用，和使用UpSet图-CSDN博客

 8章5节：用R绘制平行坐标图-CSDN博客​​​​​​​

8章6节：雷达图及RadViz图-CSDN博客

8章7节：词云图，矩形树状图和三维散点图-CSDN博客

 ​​​​​​​8章8节：绘制自定义的高质量动态图和交互式动态图-CSDN博客

第九章：临床试验的统计

9章1节：初步认识临床试验（约7500字）-CSDN博客

9章2节：样本量估计的初步介绍-CSDN博客

9章3节：用R进行样本量估计的统计学参数-CSDN博客

9章4节：两组例数相同的均数比较的样本量估计和绘制功效曲线-CSDN博客

9章5节：两组的例数不等的均数比较的样本量估计和可视化-CSDN博客

9章6节：自身配对设计的均数比较临床试验的样本量估计和可视化-CSDN博客

9章7节：与总体均数比较的样本量估计和可视化-CSDN博客

9章8节： 两、三组试验组率比较的样本量估算和可视化-CSDN博客

9章9节：试验的随机分组认识，用R做简单随机化-CSDN博客​​​​​​​

9章10节：用R实现分层随机化-CSDN博客

9章11节：用R实现区组随机化和置换区组随机化-CSDN博客

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