如何在pymol中保存高清图片

最新推荐文章于 2024-12-27 10:37:43 发布
最新推荐文章于 2024-12-27 10:37:43 发布
阅读量1.1w 收藏 11
点赞数 5
文章标签： python
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/2303_78851018/article/details/135868353
版权
本文介绍了两种方法来提升图像质量，包括在GUI中通过调整像素和DPI进行高分辨率渲染，以及使用命令行进行光线渲染并保存PNG文件。这两种方法都强调了图像放大时的清晰度和细节保持。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

方法一：在GUI图形用户界面上方的控制台先选择"Draw/Ray"，里面可以选择好像素，像素（px）越高，图片越经得起放大，我用的2800*2000，可以更高一点的，然后dpi选择300，点击Ray(slow)后save Image to File,就可以导出了PNG


方法二：在命令行输入

ray  #光线渲染

然后

png xxx.png,2800,2000,dpi=300

会保存一个xxx.png到和分子同一个文件夹下,原图如下

放大图如下，放文章里应该问题不大

pymol 动画简单制作，gif、mp4导出
weixin_42357472的博客
01-13 7130
参考： https://www.youtube.com/watch?v=G77K9Lro8js1、直接Movie下Program下，Camera Loop下Nutate下选择，这里选择30degover4 sec；如果要动画过渡自然，可以在这4sec后面再Append 1sec；如果需要两个视角，既可以再把窗口蛋白定位到比如配体，不用管中间过程怎么定位过去配体，再Program下，Camera Loop下Nutate下选择，这里选择30degover4 sec添加；最后如果要整体形成个循环播放，可以在这4s
python自动化：照片进行锐化的处理(附完整源码)
希望我的博客，能帮上你解决学习中工作中所遇到的问题
03-01 457
python自动化：照片进行锐化的处理(附完整源码)
PyMOL作图-输出PNG格式图片
MurphyStar的博客
01-05 1万+
PyMOL作图-输出PNG格式图片
Python获取高质量图片
haojuntu的专栏
10-09 1025
https://blog.csdn.net/qq_40693171/article/details/102220448
Pymol图片输出不清晰的问题以及解决办法
m0_62286036的博客
11-22 2万+
第一种情况是用的教育版免费的Pymol，这个版本不提供高质量输出文件，并且带有水印，解决办法就是换开源版的软件或者直接购买。 第二种，在开源版使用中，首先可以在命令窗口输入“helppng”看一下输出命令的详细介绍： help png png命令有五个属性：文件名、宽、高、dpi（像素密度）、ray（阴影渲染），其中文件名为必选，其他可选。 在用像素为单位时，dpi并不起作用，只有在in、cm为单位时才有效。 ...
python保存图片
maohule的博客
11-05 1万+
原图如下：                    1. 保存图片对象 img_s.save(os.path.join("/home/wanglin/PycharmProjects/data_test/data/Train400/original.jpg"))                      2.保存图片numpy数组，但是会改变图片的颜色 cv2.imwrite(os...
pymol如何把蛋白质保存为pdb
qq_39212193的博客
11-24 1万+
file–>Export Molecule–>选择存储路径（双击要保存的pdb）
windows pymol 1.7 安装　存图　背景透明
meatball1982的专栏
02-01 8732
基本思路和linux的pymol是一致的。 主要是安装文件找了半年。 有大niu放出来了。我只是转一下。 版本比较老，能用。 链接: http://pan.baidu.com/s/1qXzh6Qo 密码: gwb9 baidu的。 先安装python27.然后再pymol。 我都是选默认。 两个，windows,32,64我都放了。 用lo
Pymol用法
m0_54634272的博客
10-31 9096
Pymol是区分大小写的，不过目前为止Pymol还是只用小写，所以记住，所有的命令都是使用小写字母的。当你开始用Pymol来完成一个项目时，你也许想会让Pymol 自动保存你所有输入过的命令，以方便日后你再次读取并修改。现在Pymol就创建了一个叫2vlo的对象，你可以在内部GUI 窗口里面看见这个项目的名字。下面说说如何来操作你新建的对象。其中representation可以为：cartoon, ribbon,dots, spheres, surface和mesh。
pymol--常用指令
Daisy4的博客
12-28 2017
1）Pymol> load name.pdb, name # 载入pdb文件，并命名，我还没试过Pymol> fetch proteinID # 直接就加载了 我用的这个右边选框，有A S H L C指令。
pymol动画教程
01-18
- 在Pymol界面的右侧可以看到所有加载的对象列表。 **2. 对象管理** - **All**: 显示所有对象。 - **3ODU**: 表示当前打开的文件。 - **(sele)**: 表示被选中的对象。 **3. 操作工具栏** - **A**: 表示对...
pymol 分离蛋白与小分子保存；pymol分离蛋白多聚体亚基；pymol对接位点交互图展示；去除杂原子
weixin_42357472的博客
11-09 5686
参考：https://www.jianshu.com/p/2b8e700ff37a。
python为什么无法保存图片_无法在python中保存PIL图像
weixin_39817012的博客
12-07 1894
我试图从这里运行代码https://github.com/pytorch/examples/tree/master/fast_neural_style，我从终端python neural_style/neural_style.py eval --content-image ./images/content-images/amber.jpg --model ./saved_models/mosaic...
python输出高质量图像（DPI:300或者dpi:600）
热门推荐
Vertira的博客
04-18 2万+
SCI论文要求输出输出图像的dpi为300或者600 1.python_matplotlib 输出(保存)矢量图方法 用python的matplotlib画出的图，一般是需要保存到本地使用的。如果是用show()展出的图，再右键保存，这样的图是失帧而非矢量的 保存矢量图的方法是使用函数savefig()，官方资料：savefig) savefig(fname, dpi=None, facecolor='w', edgecolor='w', orientation='portrait'
Pymol使用技巧
Eumenidus的博客
12-01 1万+
一些pymol使用技巧汇总
『SD』文生图-如何生成高分辨率图片？
xiaolinyui的博客
05-20 1901
那如果需要生成一张高分辨率的照片，又不想出现这种诡异的情况要怎么办呢？我们可以使用 SD 提供的Hires. fix功能去放大图片。也就是我们先生成图片，基于这个图片的内容选择一个放大算法去提升图片的分辨率，然后基于这个基础上再整体重绘图片。768 x 512左图的分辨率是768 x 512，右图使用了Hires. fix功能放大了 2 倍。在使用Hires. fix出来的效果是不错的，细节也更加丰富，但随之而来的缺点也很明显，启用了Hires. fix。
pymol基础教程-2：
最新发布
weixin_62528784的博客
12-27 860
fetch 命令可以根据PDB ID编号下载蛋白结构到工作路径，并载入到PyMOL中显示,在PyMOL中的object的名字默认是PDB ID,可通过name参数进行修改。从PyMOL 1.8开始，默认的格式是cif,可通过type参数修改文件的格式，也支持根据配体ligand ID的编号下载小分子。1.本节教程是有顺序的。pdb 数据库有2个镜像库，一个是欧洲的pbde,另一个是日本的pdbj。注意颜色是有优先级的，默认设置的是atom的颜色，如果没有设置surface的颜色，则继承atom的颜色。
PyMOL中常用的命令列表
itwangyang520的博客
11-01 7521
以下是一个完整的PyMOL操作流程，包含加载文件、去除水分子、设置颜色、展示小分子和蛋白质的相互作用、标记名称、添加透明背景以及保存超清4K图像的所有步骤。这里假设蛋白质和小分子分别存储在不同的PDB文件中。：选择小分子与蛋白质之间的相互作用区域（例如，5 Å内的原子）。：标记小分子名称和关键残基，以便更好地了解相互作用。：标记小分子和蛋白质之间的距离，以量化相互作用强度。：可以用不同样式展示蛋白质和小分子，使其更易识别。：检测氢键和疏水作用，并自动添加连线。：对选定的分子区域应用不同的显示样式。
如何在pymol中放大图像
04-06
要放大Pymol中的图像，可以使用以下步骤： 1. 确保您已经打开了Pymol软件并加载了您要放大的分子结构。 2. 单击“Scene”菜单，然后选择“Show Display”。 3. 在“Show Display”对话框中，将“Window Size”设置为您想要的大小。您可以使用像素或百分比进行设置。 4. 单击“Apply”按钮以应用更改。 5. 您可以使用鼠标滚轮或键盘上的“+”和“-”键来进一步放大或缩小图像。 6. 如果您想将图像保存为图像文件，可以单击“File”菜单，然后选择“Save Image”。在对话框中选择文件格式、文件名和保存位置，然后单击“Save”按钮即可。 希望这可以帮助您放大Pymol中的图像。
评论 1
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值