Perl脚本语言在MS中的应用-科学指南针

我们使用MS来计算，一般是通过选择要用的模块，然后根据自己的需求，在对话框里设置计算参数（图1所示），然后运行计算。然而，我们并不能直观地看到我们的参数设置，有的时候因为一两个参数设置的忽略，导致我们计算的失败或者无效。

图1

如果我们可以把设置的参数写在一个文本里，是否就可以对计算的内容一目了然。在MS中，可以借用Perl脚本语言来解决这个问题。

Perl脚本语言为一种广泛应用的计算机语言，可以利用MS内含的Perl语言编辑器和Perl语言解释器进行脚本的编译和执行。本期推文主要向大家介绍Perl脚本的使用过程。

下面以Si在CASTEP中的优化为例进行说明：

首先，建立Perl脚本的操作如下：

得到一个Perl脚本：

先定义一个变量，说明我们是对Si这个结构进行计算：

my $system = $Documents{'Si.xsd'};

接着，按照一般的计算过程设置计算参数，在图1中的对话框设置，然后下拉Run，点击Copy Script，在Perl脚本中粘贴，这样就得到了Si优化晶格结构的脚本文件（图2所示）；

 图2

 

这样我们就可以直观地看到设置的计算参数。当然，我们也可以在perl脚本中直接编写这些设置参数，就不用在图1的对话框设置了。

最后，

点击Run，进行计算。

以上只是perl脚本的结构优化设置，是不是觉得还没有直接计算方便。但是，当我们的计算更复杂或者不单一的时候，会发现用脚本进行计算可以更高效，更方便。

并且还有一些计算需要用到perl脚本，例如，在MS中进行重复性的计算，我们可以通过编写perl脚本，进行批量计算；也可以通过perl脚本，在MS中实现选择性的固定原子层，具体脚本详情可查看往期推文一文读懂如何在POSCAR中固定原子坐标?；通过perl脚本，进行合金结构的建模，具体脚本详情可查看往期推文Statistic Disorder—枚举合金结构工具的使用与注意事项。

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