【代谢组学入门1】学习资源收集

大家好，最近博主将持续更新在代谢组学数据处理方面的学习笔记，作为代谢组学的入门选手，欢迎各位同学一起交流 😊

根据前段时间的调研，我感觉中文的代谢组学数据分析的教程和学习资料比较少，因此这里展示的收集资料大多数是英文的🤣

中文教材

• 脂质组学(韩贤林)
• 代谢组学：方法与应用(许国旺）

我买的是这两本教材，感觉看着还可以(请买最新版)，对入门选手较为友好

了解什么是质谱和色谱

因为代谢组学所用到的质谱/色谱这些仪器 实际是涉及分析化学领域了，因此建议先看看慕课上关于质谱和色谱的原理介绍，我看的是湖南大学的MOOC, 虽然老师像是在念PPT🤣，但是能学明白质谱和色谱的基本概念

• 中国大学MOOC分析化学之仪器分析，湖南大学

中文视频

大多是公司办的讲座，可以看看帮助入门理解代谢组学的基本概念，但是他们基本不会去讲技术细节

• 上海有机化学所的朱老师在维迈代谢的讲座，维迈代谢还请了其它几个大佬讲相关内容，可以多看看他的那个活动月的专辑推文
• 代谢组学研究技术及应用，派诺森 腾讯视频

首推资料

• 代谢组学协会建立的在线wiki 有数据库，学习资料，软件的集合

• edx上的代谢组学在线课程, 英文的

• 这本电子书综述了目前代谢组学领域常用的R包，是按数据处理步骤来综述的，值得一看，后续我也会翻译

• 对代谢组学数据处理的一个简单的overview

Workshop

• github上的workshop 数据处理
• 阿拉巴马大学伯明翰分校5年2013-2018,有视频教程，很不错 workshop：Metabolomics Workshop

英文综述

• 2018, Comprehensive Analytical Chemistry 代谢组学数据分析概述：当前的工具和未来的前景
• 2017，BIB 代谢组学数据分析:组学数据整合的工具、当前策略和未来挑战
• 2018，BIB 代谢物鉴定计算方法的最新进展和前景：以机器学习方法为重点的综述

代谢领域的国外大佬

有一位名字叫做lgatto大佬的github值得关注：https://github.com/lgatto
可以发现Bioconductor上的一些常用的代谢组学R包以及质谱数据处理方面科普资料都是他写的。。。