cel格式的表达谱芯片数据如何读取？

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后缀为cel的芯片文件，对应的芯片平台为Affymetrix, 针对这一平台的数据，可以通过R包affy来读取，读取时我们需要以下两种文件

1. 后缀为cel的探针荧光信号强度文件

2. 后缀为cdf的探针布局文件

cel文件是芯片扫描之后的原始数据文件，而cdf文件是每个芯片平台对应的文件，cdf格式的详细解释可以参考如下链接

https://media.affymetrix.com/support/developer/powertools/changelog/gcos-agcc/cdf.html

部分内容截图如下

针对一些常用芯片, bionconductor annotation收录了对应的cdf注释信息，链接如下

http://master.bioconductor.org/packages/release/data/annotation/

在读取数据的过程中，affy会根据芯片平台自动化地从annotation中下载对应的cdf包，对于那些cdf文件没有收录在annotation中的芯片，就只能通过makecdfenv包手动创建对