PaDEL-descriptor

一个可以快速计算分子描述符的软件，需要Java环境。

可以查看这个网页：yapcwsoft.com/dd/padeldescriptor/

下载链接如这个图片描述： 

下载后是一个zip包，解压后如下面所示：

只要在当前路径下打开cmd，输入：

java -jar PaDEL-Descriptor.jar

 就可以打开运行界面，在General里设置输入和输出文件夹路径，勾选想要计算的1D-3D描述符，最后点击Start就可以对文件夹下的SDF分子进行计算，图如下：

 这个速度很快，几秒就算完一个化合物，效率很高。