vcf转化问plink#流程总结

最新推荐文章于 2023-11-19 01:48:18 发布
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vcf转化问plink#流程总结

2023年2月28日

20:00

  • 选择含有所有样本的基因型文件VCF

  • 将vcf文件里面的染色体ref格式的转化为chr格式

  • 将NW_染色体记录删除不做分析

  • 将vcf转化为ped.map 格式

  • 将ped.map 格式转化为bed.bin.fam.格式进行进一步分析

  • 下面进行SNP过滤根据哔哩哔哩邓飞大佬的视频

一、文件预处理

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Jasmine_X_C
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