【一周高分】转录组学 IF ＞ 20

根据pubmed给我推送的前12篇 IF>20 “Transcriptomics” 相关文献记录，我将它们按照*“期刊-题目-主要内容”**格式整理，并分为数据分析、机制研究和其他三类：*《图代码-微信公众号-持续跟进高分组学文献》

数据分析

1. Cell - “Mapping the cellular biogeography of human bone marrow niches using single-cell transcriptomics and proteomic imaging” - 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)对29,325个非造血细胞进行分析，发现了九种不同的转录亚型，同时对53,417个造血细胞进行了分析，预测了它们与非造血亚群的相互作用。

2. Mol Cancer - “Single-cell transcriptome analysis reveals subtype-specific clonal evolution and microenvironmental changes in liver metastasis of pancreatic adenocarcinoma and their clinical implications” - 通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了未经治疗的原发性胰腺导管腺癌(PDAC)样本及其配对的肝转移样本，揭示了不同亚型特定的克隆演化和微环境变化。

机制研究

1. Nat Biotechnol - “Identification of clinically relevant T cell receptors for personalized T cell therapy using combinatorial algorithms” - 利用肿瘤反应性T细胞与旁观者细胞的转录组特征差异，构建了一个抗原不可知的计算预测器TRTpred，用于预测肿瘤反应性T细胞受体(TCRs)。

2. Cell Stem Cell - “The epidermal circadian clock integrates and subverts brain signals to guarantee skin homeostasis” - 通过构建小鼠最小时钟网络，研究了外周表皮时钟与中央脑时钟之间的联系，揭示了表皮时钟如何整合并调整大脑信号以保证表皮的日常生理。

3. Cell Metab - “The mitochondrial multi-omic response to exercise training across rat tissues” - 耐力训练改变了线粒体活性，本研究通过多组学方法绘制了雄性和雌性大鼠19种组织中线粒体响应训练的时间变化图谱。

4. Cell Stem Cell - “Generation of human alveolar epithelial type I cells from pluripotent stem cells” - 通过诱导多能干细胞(iPSCs)的定向分化，建立了体外人类肺泡上皮I型细胞(AT1)模型系统。

5. Cell Stem Cell - “Nuclear RNA homeostasis promotes systems-level coordination of cell fate and senescence” - 研究了RNA外切酶在胚胎干细胞中的耗竭对转录组和蛋白质组的影响，发现其触发了急性核RNA聚集，导致多能性丧失和早期衰老。

6. Circulation - “Epigenetic Regulation of Cardiomyocyte Maturation by Arginine Methyltransferase CARM1” - 利用体内镶嵌敲除系统，研究了蛋白精氨酸甲基转移酶CARM1在心肌细胞成熟中的作用，发现CARM1的缺失会破坏心肌细胞的成熟。

其他

1. Mol Plant - “The super-pangenome of Populus unveils genomic facets for its adaptation and diversification in widespread forest trees” - 研究者提出了一个包含19个杨属基因组的属级超泛基因组，揭示了私有基因在促进当地环境和气候适应中的关键作用。

2. Drug Resist Updat - “Development and evaluation of a human CD47/HER2 bispecific antibody for Trastuzumab-resistant breast cancer immunotherapy” - 开发了一种针对Trastuzumab耐药乳腺癌的新型抗CD47/HER2双特异性抗体(BsAb)，IMM2902，并评估了其在体外和体内的抗肿瘤效果。

3. Protein Cell - “Aging hallmarks of the primate ovary revealed by spatiotemporal transcriptomics” - 应用时空转录组学研究了年轻与年老灵长类动物卵巢的分子变化，揭示了卵巢衰老的分子基础。

4. Endocr Rev - “The Molecular Biology of Midgut Neuroendocrine Neoplasms” - 提供了中间肠神经内分泌肿瘤(NENs)的遗传、表观遗传和转录组学研究进展的综述，讨论了这些肿瘤的分子生物学特征。