LSTM案例——动态和可解释的ICU死亡风险预测

一、简介:

        该科研项目整合了2011年至2016期间,某地首都地区四个icu住院患者电子健康记录的静态数据和生理时间序列数据,通过LSTM算法对建立动态风险预测模型,以1h的时间分辨率训练一个递归神经网络。使用20%的训练数据集的holdout方法对模型进行内部验证,并使用丹麦第五医院以前看不见的数据进行外部验证。以Matthews相关系数(MCC)和接收机工作特性曲线下面积(AUROC)为指标,采用1000个替换样本的bootstrapping构建95%的CIs。将Shapley加性解释算法应用到预测模型中,得到驱动患者特定预测的特征解释,并分析模型中44个特征的贡献,并与原始SAPS-III模型中的变量进行比较。

                                 

二、话不多说上架构:

         

                             静态变量 + 动态特征               LSTM时序算法建模       SHAP模型解释

三、特征选取(静态特征 + 动态特征

1 SAPS III 模型中使用的特征

       SAPS III急性生理学评分中包括ICU入院前的患者特征、入院类型和ICU第一小时的生理紊乱标志。这些变量是静态信息和动态信息的混合

2、论文模型中使用的特征

      静态信息:基线资料(如人口统计和诊断

      动态特征每日获得的信息(如实验室值)和高采样率(如监测设备)获得的数据。

四、数据整合

连续变量被聚合为1<

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