ggplot2画图教程之Pathway富集分析（气泡图）

# 安装包 install.packages("ggplot2") # 导入包 # 帮助文档链接：http://docs.ggplot2.org/current/ library(ggplot2) # 设置工作路径到数据存放的文件夹下 # 读数据 pathway = read.table("R0-vs-R3.path.richFactor.head20.tsv",header=T,sep="\t") # 画图 pp = ggplot(pathway,aes(richFactor,Pathway)) pp + geom_point() # 改变点的大小 pp + geom_point(aes(size=R0vsR3)) # 四维数据的展示 pbubble = pp + geom_point(aes(size=R0vsR3,color=-1*log10(Qvalue))) # 自定义渐变颜色 pbubble + scale_colour_gradient(low="green",high="red"