R包UpSetR集合可视化

R包UpSetR集合可视化基础简介

UpSet图的集合展示模式

对于某元素在三个集合（A，B，C）中的分布状态，所有可能的组合如下。

其中，值1表示元素在该组中存在，值0表示元素不存在于该组。以下图为例，“1 1 0”表示元素存在于集合A、B，但不存在于C中。注意没有“0 0 0”的状态。

UpSet图使用每个元素在各集合中的1-0状态，将每个组合集的大小可视化。对于元素在各集合中的组合类型，共有三种模式。

（1）distinct mode：1表示存在于该集合中，0表示不在该集合中；例如，“1 1 0”表示集合A和B共享这个元素，而不在C中出现（等同于R的集合计算函数，setdiff(intersect(A, B), C)）；在这种模式下，七个组合集是维恩图中的七个分区，它们是互斥的。

（2）intersect mode：即交集模式，1表示存在于该集合中，考虑所有1的交集部分