【R语言】——UpSetR包绘制集合图(保姆级教程)

本文介绍了如何使用R语言的UpsetR包绘制超过5个样本的集合图,以更直观地展示多个数据集的交集情况。详细步骤包括数据准备、R包加载、数据导入以及集合图的绘制与美化,特别强调了如何通过调整参数来突出显示特定交集,同时提供了代码示例和美化技巧。

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本期介绍利用UpsetR包大于5个样本的“维恩图”,即集合图

     上期“【R语言】——VennDiagram包绘制维恩图(Venn diagram)保姆级教程”介绍2-5个样本绘制维恩图的方法,但当样本超过5个时,常规维恩图可视化结果的直观性及数据的捕捉就很困难,甚是不友好。因此,可采用一种特殊的“维恩图”——集合图(upset plot)。

    集合图(upset plot),集合图不受样本数量的限制。可以更直观的显示各组数据之间的交互情况。可以更清晰的展示多个数据集的交集情况。

下图为集合图的说明:

1 数据准备

数据输入格式(xlsx格式):

2 R包加载及数据导入

#下载包#

install.packages("UpSetR")

install.packages("RColorBrewer")

install.packages("openxlsx")

#载入包#

library(UpSetR)

libr
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