SRA数据下载

SRA数据下载

##SRA_TOOLKIT 使用方法
fastq-dump --defline-seq ‘@KaTeX parse error: Expected group after '_' at position 4: sn[_̲rn]/$ri’ --split-files SRR351933.sra

如果使用fastq-dump下载数据太慢，中间可能会断，可以直接下载sra文件，然后在去拆分。
##SRA 数据地址
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/

wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR850/SRR8506855/SRR8506855.sra
##SRA to fastq
sratoolkit/sratoolkit.2.9.0-ubuntu64/bin/fastq-dump.2.9.0 --split-files SRR8506855.sra