我在下载并解压完cellranger-6.1.1后配置环境变量
export PATH=/home/XXX/XXXX/cellranger-6.1.1:$PATH
根据官网的教程Installing Cell Ranger -Software -Single Cell Gene Expression -Official 10x Genomics Support,下一步应该直接输入
cellranger
以查看是否配置成功,但是报错提示
[User@localhost bin]$ cellranger
bash: cellranger: 未找到命令...
说明并没有配置成功,我们可以看一下cellranger-6.1.1文件夹里的这个文件 sourme.bash
如果你能打开这个文件并阅读的话(我使用的是Macbook装了CentOS虚拟机),这个文件的第一行写着