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前言
TCGA 全称 The Cancer Genome Atlas ,即癌症基因组图谱。它是一个大型的癌症研究项目,旨在通过对大量癌症患者的样本进行全面的基因组分析,来深入了解癌症的发生、发展机制。TCGA 收集了多种癌症类型的样本,包括肿瘤组织和正常组织,并对这些样本进行了基因测序、基因表达分析、DNA 甲基化分析等多种组学层面的研究。TCGA数据库中包含了多种肿瘤类型的数据,如乳腺癌、肺癌、结直肠癌、肾癌等,其中每个肿瘤类型的数据都是由不同实验室和机构采集和上传的,数据涵盖了基因组、转录组、表观基因组和临床等多个层面,可以用于基因组学、生物信息学和医学领域的研究和应用。
通过 TCGA 产生的数据,科学家们能够发现新的癌症相关基因、了解癌症的分子亚型、探索癌症治疗的潜在靶点等,这对于癌症的诊断、治疗和预防都具有重要的意义。
一、如何使用TCGA数据库获取公共数据?
- url: TCGA数据下载挂网
- 通过条件筛选过滤数据
- 下载数据