【推荐】2024化合物信息查询平台

化合物信息查询平台是一个综合性的在线资源，它为科研工作者、化学工程师、教育者、学生以及相关领域的专业人士提供了一个全面获取化合物信息的途径。此类平台通过强大的搜索功能，允许用户根据化学名称、分子式或结构式快速定位所需化合物，进而访问其详尽的物理化学特性、详尽的安全数据表、可能的合成路径、药理作用、市场供应情况、三维结构模型、反应性预测、相关科学文献、专利信息、分析测试方法以及化合物在医药、化工、材料科学等领域的应用情况。这些丰富的信息不仅有助于推动科学研究和技术创新，也对教育、工业生产和市场分析等方面具有重要价值。现今总结几个化合物信息查询平台：

1）PubChem

平台访问网址：https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/

截至2024年6月，NCBI旗下的PubChem数据库汇集了超过1.18亿种化合物的结构信息（Compounds子库）、3.2亿种用户贡献的化合物数据（Substance子库）、2.95亿种有实验或文献支持的生物活性数据（BioAssay子库）。此外，数据库还涵盖了4100万篇相关科学文献和5100万项专利信息，覆盖了113242个基因、247611个蛋白质和241163条生物通路。引用的数据来源广泛，总计达到995个。PubChem的丰富资源，包括化合物结构、物理化学属性、生物活性、毒性和安全性数据，以及详尽的文献和专利支持，使其成为生物医药和生物化学研究者的重要工具。

PubChem化合物信息查询平台可以帮助用户查找特定化合物的结构和性质，探索已知的生物活性数据，并在研究过程中提供宝贵的参考信息。以阿司匹林aspirin为例，检索得到结果：一条最佳检索的结果（阿司匹林单体数据），106条化合物结构信息（包括阿司匹林单体和混合药物数据），835条底物数据，39条通路数据，2246条药物活性数据，7万多条文献和专利。

点击‘best match’下的第一条数据，详情页中有aspirin信息概览，包括PubChem CID、化合物结构、化学安全分类、分子式、同义词、分子量和数据更新时间，并提供aspirin药理功能注释和肝毒性信息，提供NCI Thesaurus、LiverTox和DrugBank数据库链接。右侧栏为该页面所展示的信息目录。

 

2）Zinc

平台访问网址：https://zinc.docking.org/

ZINC数据库是一个小分子结构数据库，由美国加州大学旧金山分校（UCSF）创建和维护的数据库。最初目的是为了方便访问用于虚拟筛选的化合物数据，这些数据广泛用于虚拟筛选、配体发现、药效团筛选、基准测试、和力场开发。

ZINC数据库包含包括片段库、类药性库、药物库、天然产物库等，这些化合物含有供应商、分不量可旋转键数氢键受体及供体等信息。这些化合物的详细信息包括化合物的结构，一些化合物的重要性质，包括xlogP，溶解度，氢键给体和受体数目等，以及二维和三维结构，供应商信息。用户可以免费获取这些化合物数据，支持批量下载，并提供多种数据分类和相关信息，以满足不同用户的兴趣和需求。此外，ZINC数据库支持多种文件格式，如SMILES、mol2、3DSDF和DOCK flexibase，以适应不同的应用场景。用户还可以将化合物的相关信息下载为表格形式，这使得数据的管理和使用更加便捷，特别适合于虚拟筛选和药物设计等研究领域。

Zinc数据库中的化合物可以通过多种方式进行检索和筛选，包括结构相似性搜索、化学性质过滤、生物活性数据筛选等。进行单个分子搜索时，可以通过化合物名称，SMILES，SMARTS，InCHI，InChIkey，ZINC ID等字符进行搜索，也可以通过化学结构式进行搜索，然后选择进行相似性搜索或子结构搜索。

3）MolAid化学数据库

平台访问网址：https://chem.molaid.com/

MolAid是一个创新的化合物信息查询平台，它以网页端为核心，辅以移动端，形成了一个多终端的化学合成辅助工具。该平台整合了全球范围内的大量化学数据，涵盖了超过1.6亿种化合物、5000万条反应信息、740万条商品数据、180万条安全数据、100万条晶体数据和20万条谱图数据。MolAid不仅提供化合物的物理化学性质、毒性数据，还包含文献、晶体结构和谱图等详细信息。用户可以通过它查询化合物信息、探索物质特性、查找购买渠道、了解反应条件、规划合成路径、进行谱图检索、预测化合物性质及其谱图，全面覆盖了化学合成的各个环节。

以化学式“C5H10O2”为例，会检索到以下几种物质，点击“正戊酸”，会出现该化合物的相关信息。包括物化性质、计算性质、安全信息、SDS、谱图晶体、商品信息等内容。近期新增“谱图预测”“反应详情新增文摘数据”两大功能，（目前还没玩明白，以后详讲）。

值得一提的是，最近有福利活动，邀请好友立得会员，更有周边、书籍等奖励。这波必须薅羊毛！

4）ChemSpider

平台访问网址：http://www.chemspider.com/

ChemSpider是一个面向化学界学者和专业人士的在线化合物信息查询平台，提供丰富的化学结构及相关数据。隶属于英国皇家化学会的汇总数据库，于2009年被英国皇家化学学会(Royal Society of Chemistry, RSC) 收购。该网站建立目的是将化学结构及其相关信息进行整合，建立一个以化学结构式为搜索引擎的数据库，该数据库对所有使用者均免费开放。

目前，ChemSpider数据库整合了多种资源，包括海洋天然产物数据、ACD实验室化学数据库、美国环保署（EPA）的DSSTox数据库，以及众多供应商提供的化学物质信息。它提供了多种查询方式：标准查询方式包括系统名称、商业名称和同义词、登记号查询；高级查询方式提供互动式搜索，通过化合物结构、化合物子结构，分子式以及分子量、CAS编号、供应商等进行高级搜索。

5）ChEMBL

平台访问网址：https://www.ebi.ac.uk/chembl/

ChEMBL是一个专注于生物活性分子的数据库，主要聚焦于药物发现和药物研究。它汇集了广泛的化合物活性数据，这些数据源自科学文献、专利资料以及药物注册信息。截至目前，ChEMBL已经涵盖了超过15000个生物靶点和240万个化合物，记录了超过2000万条生物活性数据。

该数据库为研究人员提供了全面的药物信息，包括化合物的结构、计算属性、生物活性数据以及与治疗靶点和适应症相关的注释，以及这些化合物与生物分子（如蛋白质、酶、离子通道等）之间的相互作用数据，，还包含分子的2D结构、计算属性（如logP、分子量、Lipinski参数等）和生物活性摘要（如结合常数、药理学和ADMET等数据）。研究人员可以利用ChEMBL数据库探索具有特定生物活性的化合物，分析结构与活性之间的关系，并从中获得有价值的洞见，以推进药物设计和开发过程。

例如输入以“aspirin”为例，在搜索框内输入化合物名称。出现相关的51个化合物，左边有筛选框，罗列了检索到的该化合物各种特性的统计，包括分子类型（Type）、最大临床试验期（Max Phase）、违反五条规则的次数(#RO5 violations)、分子量（Molecular Weight）等内容，并且允许用户通过点击相应的数值浏览给定范围内的原始数据子集。点击某一化合物名字，可查看该化合物的详细内容。

6）DrugBank

平台访问网址：http://www.drugbank.ca
DrugBank是一个综合性的药物信息数据库，由加拿大阿尔伯塔大学的专业团队开发并维护，它提供了一个免费的在线访问平台，致力于成为研究人员和医疗专业人员的宝贵工具。这个数据库详尽地收录了药物的多方面信息，包括但不限于药物靶点、相互作用、作用机制以及药效学和药动学特性。

DrugBank所包含的药物信息极为广泛，涵盖了药物的CAS登记号、商品名、分子式、分子量、SMILES、2D和3D化学结构、脂溶性（logP）、水溶性（logS）、电离常数（pKa）、熔点、吸收性、Caco-2细胞穿透性等物理化学参数。此外，还包括药物的分类、临床应用、剂型、给药途径、半衰期、体内代谢过程、毒性资料、食物相互作用、与其他药物的相互作用、作用机制、代谢途径、药理学特性、蛋白质结合情况、溶解度、物态、同义词、合成路线的相关文献等。DrugBank的目标是通过提供这些综合信息，促进对药物深层次理解，帮助医疗专业人员和研究人员在药物开发、临床实践和科研工作中做出更明智的决策。

7）Molbase

平台访问网址：https://www.molbase.com/

MOLBASE摩贝，是一个由上海摩库数据技术有限公司管理的全球化学品电商综合服务平台。最初作为中科院的研究数据平台，摩贝的商业版自2013年9月启动以来，已扩展服务至全球化工、医药和新材料等多个行业。该平台致力于构建一个全面的产业生态系统，涵盖化合物数据管理、化学品现货交易、支付与结算服务、供应链金融服务、专业物流和仓储解决方案，以及专业的化学品进出口服务。

Molbase是化合物信息查询平台，目前已收录了4500多万条化合物数据，用户可以通过化学品名称、CAS号或结构式等多种方式进行高效检索，包括化合物性质、上下游关系、MSDS、专业图谱等的化合物百科数据。主要提供化合物产品购买相关、化合物百科、行情资讯这几大板块信息。这个数据库已成为全球最大的免费商用化合物百科数据库之一。

摩贝在检索时将类别设置为百科即可获取相关信息，如中英文名称、分子量、相关编码（EINECS号、BRN号、MDL号、PubChem号等）、物质的物化，安全信息等，感兴趣的还可获取该物质的生产方法及用途。

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