Training population
对于训练群体，分别分析了DP1和DP2数据集，并跨数据集和环境进行了合并。对于每个数据集，分别在每个环境(位点-年份)中进行分析，并在所有环境中组合进行分析。分别用于单个环境和组合环境的方差分析的线性混合模型的形式如下：
y
i
j
k
=
μ
+
G
i
+
R
j
+
B
j
k
+
ϵ
i
j
k
(
1
)
y_{ijk}=\mu+G_i+R_j+B_{jk}+\epsilon_{ijk}\qquad(1)
yijk=μ+Gi+Rj+Bjk+ϵijk(1)
y
i
j
k
l
=
μ
+
G
i
+
R
j
l
+
B
j
k
l
+
E
l
+
(
G
E
)
i
l
+
ϵ
i
j
k
l
(
2
)
y_{ijkl}=\mu+G_i+R_{jl}+B_{jkl}+E_l+(GE)_{il}+\epsilon_{ijkl}\qquad(2)
yijkl=μ+Gi+Rjl+Bjkl+El+(GE)il+ϵijkl(2)
其中，
y
i
j
k
y_{ijk}
yijk和
y
i
j
k
l
y_{ijkl}
yijkl表示在第
l
l
l 个环境的第
j
j
j 个重复内的第
k
k
k 个不完全区块中的第
i
i
i 个基因型的观察特性，
μ
\mu
μ是总体均值，
G
i
G_i
Gi是第i个基因型的效应，
R
j
l
R_{jl}
Rjl是第
l
l
l 个环境的第
j
j
j 个重复的效应，
B
j
k
l
B_{jkl}
Bjkl是第
l
l
l 环境的第
j
j
j 个重复内的第
k
k
k 个不完全区块的效应，
E
l
E_l
El是第
l
l
l 环境的效应，
(
G
E
)
i
l
(GE)_{il}
(GE)il是第
l
l
l 环境与第
i
i
i 基因型之间的互作效应，
ϵ
i
j
k
\epsilon_{ijk}
ϵijk或
ϵ
i
j
k
\epsilon_{ijk}
ϵijk是试验残差。基因型效应被认定为固定效应，且可重复。而嵌套在重复中的区块是随机的，并在每个环境中单独分析数据。对于跨数据集和环境的数据的联合分析，将嵌套在环境中的复制、嵌套在复制和环境中的区块、环境(站点年份)和基因型与环境的交互作用视为随机效应。
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