本文介绍了R语言在生物信息学（生信）领域的广泛应用，特别是其在统计分析和绘制专业图表上的优势。R语言由于其全面的统计函数和简洁的代码，深受生信分析人员喜爱。尽管一些计算机背景的学者可能因其数组从1开始的特性而不习惯，但其强大的绘图功能使得R在经济、金融甚至生物学文献中都有广泛使用。作者建议生信人员应熟练掌握R、Shell和Python/Perl这三种语言，以应对包括机器学习在内的各种工作需求。
原创： hxj7
关键词：R; 统计; 美图
作为一个生信er，光会处理文本数据是不够的，还要能进行统计分析。作为一个开源软件，R在统计社区“大行其道”，在生信分析人员中更是“一家独大”。为啥？因为R语言就是一群统计学家开发的，统计函数齐全，新的统计方法很快就会有相应的包被开发出来。复杂的统计分析往往两三行代码就可以完成，那个方便呦，谁用谁知道！
（不过，也有许多学计算机专业出身的同学很不喜欢R，各种不顺眼…。比如，R的数组下标是从1开始的，而诸如C、Python等语言都是从0开始，光这一点就让他们抓狂。他们迫不及待地就去拥抱numpy、pandas了！）
图1：lm函数进行线形回归分析，一行代码即可实现
那如何学习R呢？方法很多，我个人是看着《R语言实战》这本书自学的。相信很多生信人都知道它，诚如作者在书中说，当时国内R语言的资料很少，许多想学习R语言的人都备受煎熬。以至于这本书一问世，便广受好评（像不像做广告的~）
图2：《R语言实战 第二版》
上面讲了那么多，还有一点不得不提。其实R为众多行业的人广泛接受，不止因为它强大而便捷的统计分析功能
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