肝细胞癌Anoikis相关亚群的鉴定及预后模型

研究背景

1、肝细胞癌（hepatocellular carcinoma， HCC）是最常见的肝癌形式，是全球第四大死亡原因和第二大致死恶性肿瘤。尽管组织学和影像学检查等诊断工具的可用性有限，但对快速、准确和便捷的HCC诊断方法的需求仍然很大。因此，开发新的诊断方法来监测癌症的进展至关重要。尽管临床相关的生物标志物（如α-fetoprotein， AFP）通常用于HCC诊断，但其应用存在许多争议和局限性[4]。此外，在19例HCC患者中发现了FGF1、CCDN2、CDKN2A和CDKN286B基因的拷贝数改变，表明这些分子对HCC的发展具有特异性[5]。综上所述，开发新基因对肝癌的诊断和预后具有重要意义。

2、Anoikis是一种程序性细胞死亡，由细胞与细胞外基质（ECM）之间的相互作用丧失引发。在正常细胞中，这种相互作用被细胞表面的无力引发分子和糖基化ECM蛋白破坏，导致细胞凋亡和细胞死亡。相比之下，肿瘤细胞受到“屏障”的保护，该屏障可阻止无力症引发分子的激活并保护它们免受细胞死亡，从而产生对无力症的抵抗力并促进细胞存活。最近的研究揭示了调节厌食症抵抗的分子途径和机制，包括细胞粘附分子、生长因子和诱导上皮-间充质转化的信号通路。这些途径中的下游分子，如黏着斑激酶、Src激酶、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）、ERK1/2、Bcl-2家族、PI3K/Akt和胰岛素样生长因子受体已被证明在抗细胞凋亡和促生存中发挥重要作用。此外，已发现特定分子与各种类型的癌症有关。例如，Toll样受体（toll-like receptor， TLR）可识别致瘤细胞释放的损伤相关分子模式，可激活T细胞并去除致瘤细胞[18]。据报道，toll样受体4配体、锰超氧化物歧化酶、胶原XIII、核因子κB（IκB）激酶-ε（IKKε）和乳腺癌-1（DBC1）缺失与三阴性乳腺癌的无力抗性有关[19]。Trk激酶、Hippo通路和eEF-2激酶与胶质瘤相关[20]。然而，anoikis在HCC进展和侵袭中的分子机制和途径仍然未知。同时，药物化合物和分子抑制剂已被用于治疗由无力抗性引起的转移性肿瘤。DZ-50是一种新型喹唑啉类化合物，可诱导无力减少肿瘤与ECM之间的细胞粘附，并阻止肿瘤生长和新生血管形成[21]。Glo1抑制剂通过在细胞内积累甲基乙二醛来促进无力，从而发挥抗肿瘤作用[22]。因此，揭示肝癌中无力症的细胞特征和分子机制至关重要，这有利于肝癌的治疗发展和预后。

3、在这项研究中，我们应用了全面和多尺度的生物信息学分析来识别HCC的关键调控因子和重要的预后基因。我们应用无监督聚类算法对基于差异表达重叠的 anoikis 相关基因的癌症基因组图谱 （TCGA） 数据集进行聚类。然后，我们使用加权基因共表达网络分析（WGCNA）来识别最高度相关的基因，并在基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路中进行富集分析，以寻找潜在的生物学通路。我们还利用单因素Cox回归、最小绝对收缩和选择算子（LASSO）回归和多因素Cox回归分析筛选预后基因，并构建预后风险模型。此外，我们探索了浸润免疫细胞与预后基因和风险评分的相关性。综上所述，本研究发现了与HCC肿瘤微环境相关的新型调控基因，对HCC诊断和治疗的预后基因的开发具有重要意义。

以下是相关链接

视频链接：零代码复现2-基于TGF-β个性化纯生信套路

工具链接：零代码复现 - 生信豆芽菜 - 专门做分析的生信平台.

文章解读链接：文章解读-肝细胞癌Anoikis相关亚群的鉴定及预后模型

原文链接：