myBaits Expert 16S-Hyb panel，利用16S rRNA基因的无扩增子靶向测序分析微生物群落，鉴别样本中微生物种类并定义微生物群落内关系（宏基因组学）

Analyze microbial communities using amplicon-free targeted sequencing of the total 16S rRNA gene.
鉴别样本中微生物种类并定义微生物群落内关系，在人类健康、环境调查、动物保护和农业改良等方面均有重要的应用。 16S rRNA 测序，经常用于鉴定和分析样本的微生物群落组成。

myBaits Expert 16S-Hyb Panel 运用杂交捕获技术，可以富集整个16S 基因，而不仅仅是一两个高变区（hypervariable regions）。与16S扩增子测序相比，具有更好的分类分辨率和更少的偏差。此试剂盒结合宏基因组方法，还可以有效鉴 别全新表型的稀有微生物，并降低单个样本的测序深度。将16S-Hyb rRNA 基因富集测序与低覆盖度⻦枪法测序相结合， 可以更高效地鉴别宏基因组样本中的微生物种群，比单独的shotgun法测序成本低，并且比 16S 扩增子测序更准确。

myBaits Expert 16S-Hyb Panel 为完整试剂盒，包含各种 blockers 、杂交探针和验证过的操作流程。此外，我们也提供全流程的技术服务。

特点

快捷 – 可直接使用⻦枪法的 NGS 文库进行捕获测序
低成本 – 可用较少的测序量鉴别宏基因组样本中的稀有类群
低偏差 – 有效避免 16S 扩增子测序引入的扩增偏差
高分辨率 – 检测全部保守和高变区域
开放平台 – 与各种 NGS 文库平台兼容，包括长读长测序
组分齐全 – 试剂盒包括 NGS 文库捕获所需的所有试剂

应用

• 宏基因组学
• 环境采样
• 古 DNA
• 微生物组分析
• 长读长测序

与扩增子测序法相比，16S-Hyb 准确性更高

在人造模拟群落、⼩鼠粪便和⼤鼠结肠的样本中，比较 myBaits 16S 捕获测序、16S 扩增⼦测序和⻦枪法宏基因组测序法。未经富集的宏基因组测序（⻦枪法）收集到的数据，16S 约占总数据量的 0.1-0.2%；与之相 比，myBaits 16S-Hyb 捕获测序中，60-70% reads 可以比对到 16S 区域，在模拟群落样本中富集了 350 倍，⼩鼠粪便和⼤鼠结肠样本中富集了 450 倍。myBaits 16S-Hyb 捕获测序与扩增子测序法相比，无论用 MiSeq 或 HiSeq 测序，样本富集图谱更接近于模拟群落组成和⻦枪法图谱。

图1 模拟样本类群分析
样本“BEI Resources 模拟群落”包含已知含量的细菌群（第5列），分别使⽤16S扩增⼦测序- MiSeq PE 300（第1列）、myBaits 16S-HybMiSeq PE 300（第2列）、myBaits 16S-Hyb-HiSeq PE 150（第3列）和⻦枪法宏基因组测序-HiSeq PE 150（第4列）。 杂交捕获和⻦枪法测序的 reads 过滤后，使⽤ bbmap 比对到GreenGenes 数据库分析。扩增子测序的 reads 用 Dada2 pipeline 处理后比对到GreenGenes 数据库。

图2. 16S 扩增子测序 vs 16S Hyb vs ⻦枪法
从⼩鼠粪便和⼤鼠结肠中提取的DNA样本，分别使用 16S 扩增⼦测序- MiSeq PE 300（第1,5 列），myBaits 16S-Hyb- MiSeq PE 300（第 2,6列），myBaits 16S-Hyb-HiSeq PE 150（第3,7列）和⻦枪法宏基因组测序-HiSeq PE 150（第 4,8 列）进行分析。 杂交捕获和shotgun法测序的 reads 过滤后，使⽤ bbmap 比对到 GreenGenes 数据库分析。扩增子测序的 reads 用 Dada2 pipeline 处理后比对到 GreenGenes 数据库。

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