AI4S - AlphaFold: Monomer MSA 特征的源码(1) 教程

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AlphaFold 是基于深度学习的方法，可以根据氨基酸序列，预测蛋白质的三维结构。在 CASP 竞赛中，展示惊人的准确性，达到了原子级别的精度。AlphaFold2 的核心思想是利用 多序列比对(MSA) 和进化信息来构建蛋白质的特征表示，然后，使用一个 Transformer 模型来预测残基之间的距离和角度，最后，使用一个结构模块来优化和输出三维坐标。AlphaFold 的创新之处在于它能够端到端地训练和预测蛋白质结构，同时融合了物理和生物学的知识。AlphaFold 为蛋白质科学和生命科学领域，带来了新的机遇和挑战。