【Image J】荧光染色图像处理

今天给大家带来一个保姆级教程，如何使用Image J软件处理不清晰或“难看”的荧光染色照片，以及将两张或多张荧光染色图片进行merge操作的方法。

今日份干货分享导航：

1  单色荧光染色图片处理；

2  未Merge过的荧光染色图片处理；

3　已经Merge过的荧光染色图片处理。

1 单色荧光染色图片处理

Step.1 打开Image J软件。打开以后出现以下界面既打开成功

Step.2 导入需要处理的荧光染色图片。在所在的文件夹中找到你所需要处理的荧光染色图片

以下为本次处理的示例照片    

Step.3 单色荧光染色图片处理。依次按以下顺序进行操作Image -> Adjust -> Brightness/Contrast -> 调整Maximum或Minimum的阈值（通常只处理Maximum就可以） ->  Apply -> File -> Save/Save as

调整完以后的DAPI以及EDU图。    

PS：调整完阈值以后切记、切记、切记点击Apply

              

2　未Merge过荧光染色图片处理

Step.1 打开meige处理功能。依次按以下顺序进行操作 Image -> Color -> Merge Channels

          

Step.2 Merge蓝色和红色两张荧光染色图片。示例中merge的照片是蓝色和红色，因此将处理过的“红色EDU”图片和“蓝色DAPI”图片分别放到相应颜色的通道中，勾选“Keep source images”，点“OK”就可完成merge。PS：完成merge的图片还需要进行保存（Save/Save as）    

Merge效果图如下    

Step.3 Merge图片保存。依次按照以下顺序 File -> Save/Save as

3　已经Merge过的荧光染色图片处理

Step.1 Merge图片导入。图片导入方法与第一节图片导入方法一致，以下为本次处理的图片    

Step.2 Merge图片处理。依次按以下顺序进行操作Image -> Adjust -> Color Balance -> 选择调整的通道，调整merge图里不同的荧光染色，原则上先调节弱的颜色，后调整强的颜色 -> Apply

蓝色荧光染色调整，依次按以下顺序：调出“blue”-> 调整Maximum或Minimum -> Apply    

红色荧光染色调整，依次按以下顺序：调出“red” -> 调整Maximum或Minimum -> Apply

    

 Step.3 Merge处理图片保存。依次按照以下顺序 File -> Save/Save as

          

最后结果对比

PS：文中图片只是示例图片，不可当作实验图片胡乱使用

好了本次分享就到这里，关注微信公众号“在打豆豆的小潘学长”有更精彩内容，敬请期待。

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