KEGG数据库的使用

B站up _Willow_Liu

KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes

KEGG数据库的基本构成

整合了基因组、化学和系统功能信息的综合性数据库

大致分为系统信息、基因组信息、化学信息和健康信息四大类

查询代谢途径、酶、基因、产物等，BLAST查询未知序列的代谢途径信息

常用子数据库

PATHWAY(代谢途径数据库) 查询各种代谢途径

BRITE(代谢通路及同源基因数据库) 查询酶和底物之间的关系，查询某种酶的同源基因

GENES(基因数据库) 查询不同的基因或基因组的信息

LIGAND(配体数据库) 查询反映猴子那个各种化合物的信息

KEGG Organisms列出各物种的代码、KEGG使用三个英文小写字母代表各个物种

PATHWAY基本使用

查询各种代谢途径

KEGG-->KEGG PATHWAY-->Carbohydrate

红色方框--反应中的酶

红色椭圆--反应中的化合物

箭头--反应的方向

虚线--此反应可通过中间产物与其他途径发生联系

选择菜单 中 Animals--Mammals--hsa Homo sapiens(human)