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KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes
KEGG数据库的基本构成
整合了基因组、化学和系统功能信息的综合性数据库
大致分为系统信息、基因组信息、化学信息和健康信息四大类
查询代谢途径、酶、基因、产物等,BLAST查询未知序列的代谢途径信息
常用子数据库
PATHWAY(代谢途径数据库) 查询各种代谢途径
BRITE(代谢通路及同源基因数据库) 查询酶和底物之间的关系,查询某种酶的同源基因
GENES(基因数据库) 查询不同的基因或基因组的信息
LIGAND(配体数据库) 查询反映猴子那个各种化合物的信息
KEGG Organisms列出各物种的代码、KEGG使用三个英文小写字母代表各个物种
PATHWAY基本使用
查询各种代谢途径
KEGG-->KEGG PATHWAY-->Carbohydrate
红色方框--反应中的酶
红色椭圆--反应中的化合物
箭头--反应的方向
虚线--此反应可通过中间产物与其他途径发生联系
选择菜单 中 Animals--Mammals--hsa Homo sapiens(human)