CHARLS数据库系列教程(2)---数据清洗、拼接和整理(1)

写在前面的话,本节内容实在太多了,只能做了一个小合集,分成2章来介绍。
CHARLS 是一项具备中国大陆 45 岁及以上人群代表性的追踪调查,旨在建设一个高质量的公共微观数据库,采集的信息涵盖社会经济状况和健康状况等多维度的信息,以满足老龄科学研究的需要。

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在上一篇文章《CHARLS数据库挖掘系列教程(1)—数据库下载》中,咱们已经CHARLS数据库进行了初步的介绍,今天咱们以文章《Association Between Triglyceride Glucose Index and Risk of New-Onset Diabetes Among Chinese Adults: Findings From the China Health and Retirement Longitudinal Study》为例子,介绍一下怎么进行数据数据下载、清洗和拼接。

CHARLS数据最麻烦的就是整理数据了,因为没有成熟的查对系统,一边整理一边查找变量,我整理了这份数据也花了2天时间,整理数据内容比较多,光代码都有100多行,1章实在说不完,准备写成个2章得小合集,尽量介绍得详细一点。

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首先咱们要了解作者是做了什么,怎么做的。作者研究的是一个叫做甘油三酯葡萄糖指数与新发糖尿病的关系。作者指出甘油三酯葡萄糖指数被认为是胰岛素抵抗的替代物,研究TYG指数与中国中年和老年人患糖尿病的风险之间的关系,作者做了cox回归,分位数回归、多模型比较、限制性立方样条和亚组分析,咱们在后面将会一一进行介绍,咱们先看看作者是怎么获取数据的,主要看流程图

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接下来咱们跟着作者的思路来一步步进行,先是要把2011年数据下载下来,数据在这里下载

获取全部代码请看这篇文章:
CHARLS数据库系列教程(2)—数据清洗、拼接和整理(1)

charls是一种用于数据清洗的编程代码,通常用于处理数据集中的异常值、缺失值以及数据格式问题,以确保数据的质量一致性。在编写charls数据清洗代码时,你可能会使用一些特定的编程逻辑工具函数来完成以下任务: 1. 缺失值处理:可以识别数据集中的缺失值,并决定是删除这些行、用均值、中位数或众数等统计量替换,还是用特定的标记表示。 2. 异常值检测:通过统计测试或者箱线图等方法检测异常值,并根据业务规则决定是删除、修正还是保留这些值。 3. 格式标准化:将数据格式统一,比如日期格式转换、文本大小写转换、数值的四舍五入等。 4. 数据类型转换:确保数据集中字段的数据类型正确,比如将字符串类型转换为日期类型,或者将整数类型转换为浮点类型。 在实际的数据清洗过程中,具体的代码实现会依赖于你使用的编程语言处理数据的库。例如,在Python中,你可能会使用pandas库来处理数据集: ```python import pandas as pd # 加载数据集 data = pd.read_csv('dataset.csv') # 处理缺失值,例如用列的均值填充 data.fillna(data.mean(), inplace=True) # 检测并删除异常值,这里仅为示例,实际情况需要依据业务逻辑 # 假设我们的数据是正态分布的,可以使用标准差来定义异常值 z_scores = (data - data.mean()) / data.std() abs_z_scores = abs(z_scores) filtered_entries = (abs_z_scores < 3).all(axis=1) data = data[filtered_entries] # 数据格式标准化 data['date'] = pd.to_datetime(data['date'], errors='coerce') # 数据类型转换 data['number'] = data['number'].astype(float) # 保存清洗后的数据 data.to_csv('clean_dataset.csv', index=False) ```
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