生物信息学学习笔记（二）--蛋白质的结构分析与预测Structural analysis & prediction of proteins

生物信息学-蛋白质的结构分析与预测

Structural analysis & prediction of proteins

1.蛋白质结构分类 (Classification)

primary structure—secondary structure—Domain

SCOP分类数据库
蛋白质结构分类数据库SCOP（structure classification of proteins）
SCOP的层次:家族（family）、超家族（superfamily）、折叠（fold）、结构类型（class）

蛋白质家族：

1.（序列含义）对位排列具有大于50%的同一性，且具有相似生化功能的一组蛋白质。–SCOP, CATH

2.（结构含义）具有显著结构相似性但序列相似性并不必需的一组蛋白质。 --FSSP/DALI
蛋白超家族： 有远源序列相似性的不等长度的蛋白质家族的组合。超家族成员具有共同的进化祖先