MNI152 坐标空间和 fsaverage 坐标空间相互转换
有时候需要将MNI152 空间的统计结果转换到fsaverage 空间上进行可视化,有时候需要将fsaverage 空间的分区模板投射到MNI152 空间用于分析。如何实现MNI152 和fsaverage 之间的相互转换?
原理
大多数神经影像学研究的结果是在体积(例如,MNI152)或表面(例如,fsaverage)坐标系中报告的。体积坐标系和表面坐标系之间的准确映射可以促进许多应用,例如将 fMRI 组分析从 MNI152 投影到 fsaverage 以进行可视化或从 fsaverage 投影静息状态 fMRI 分区对 MNI152进行新数据的体积分析。Wu et al., 2018 评估了三种在 MNI152通过模拟上述应用的 Colin27 和 fsaverage 坐标系:将组平均数据从 MNI152/Colin27 投影到 fsaverage 和 fsaverage 分区的投影到 MNI152/Colin27。
这里提到的方法基于Wu et al., 2018,在文章中称为RF-ANTs,思路是将一组被试的T1 像使用FreeSurfer 的recon-all 进行处理,得到T1 和fsaverage 的映射关系;同时使用ANTs 将T1 像配准到MNI152,得到T1 和MNI152 的映射关系;将两个映射关系结合并将所有被试进行平均,就得到了MNI15