Windows 下R软件如何安装GO.db程序包

最新推荐文章于 2024-08-31 22:30:38 发布
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分类专栏： 生物信息学 文章标签： 生物信息学 R包安装 数据
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在Windows操作系统中，安装R语言的GO.db包可能遇到一些挑战。本文将详细指导用户如何顺利安装这个重要的生物信息学数据包，包括解决依赖问题和使用安装源的方法。
摘要由CSDN通过智能技术生成

Windows 下R软件如何安装GO.db程序包

问题描述：

因为分析数据要用到WGCNA，然而安装WGCNA必须先安装GO.db。
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bioconductor常用包(GO.db等)安装问题
qq_43340469的博客
04-18 8165
项目场景： 在绘制微生物相互作用网络时，需要用R语言的igraph计算相关的参数。其中需要用到bioconductor的各类包，尤其是WGCNA是函数计算使用的前提。 问题描述 在R4.0.3安装bioconductor的常用包时，所使用的代码是： package_list <- c("digest","AnnotationDbi", "impute", "GO.db", "preprocessCore","WGCNA","multtest") for(p in package_list){ i
不存在叫‘GO.db’这个名字的程辑包
weixin_70093396的博客
05-18 1267
复制报错信息中：https://bioconductor.org/packages/3.16/data/annotation/src/contrib/GO.db_3.16.0.tar.gz。Tools→install.packages→Browse→选择下载的文件→install即可。载入需要的程辑包：fastcluster。不存在叫‘GO.db’这个名字的程辑包。不存在叫‘GO.db’这个名字的程辑包。载入程辑包：‘fastcluster’下载程序包‘GO.db’时出了问题。安装源码包‘GO.db’
R包GO.db_3.0.0.zip
07-13
在生物信息领域使用R语言进行差异表达基因的GO分析时，需要改包的安装
R包GO.db安装
最新发布
weixin_46636238的博客
08-31 266
【代码】R包GO.db安装。
WGCNA中安装GO.db提示错误
ziixiaoshenwang的博客
06-02 6946
错误提示为 library(WGCNA) 错误: package or namespace load failed for ‘WGCNA’: package ‘GO.db’ was installed before R 4.0.0: please re-install it 最好先把旧版本的GO.db删掉，个人习惯，不删会怎么样我也不知道 remove.packages(“GO.db”) 然后从GO.db - Bioconductor下载tar.gz包 网址：http://bioconductor.
Go语言开发包安装
qq_36214481的博客
03-20 421
1、开发包下载 Go语言官方网站，网址为：https://golang.google.cn/dl/ 如图所示1.12.1版本的下载页面。其中加粗的为官方推荐下载版本 本文只介绍windows版安装，安装包为msi格式。为了节省C盘空间，本文安装在D盘 直接点击Next安装即可，安装过程不需要任何操作，安装完成后，生成一下目录 该目录结构遵守GOPATH规则。GOPATH及...
mongodb安装教程
weixin_30509393的博客
11-17 86
mongoDB 安装步骤 1.下载monggoDB的安装包： https://www.mongodb.com/download-center#community； 2.下载完成以后进行安装： 点击下一步→下一步→选择自定义安装程序→下一步→同意开始安装； 建议：在自定义安装程序的时候尽量在C盘或者D盘下建一个mongoDB文件夹，按照到改文件夹下，方便...
go语言之读配置文件程序包开发
weixin_43953962的博客
10-20 391
ini配置文件读取程序包开发一、概述二、课程任务1、任务目标2、任务内容3、任务要求三、函数设计1、核心函数Watch 一、概述 配置文件（Configuration File，CF）是一种文本文档，为计算机系统或程序配置参数和初始设置。传统的配置文件就是文本行，在 Unix 系统中随处可见，通常使用 .conf,.config,.cfg 作为后缀，并逐步形成了 key = value 的配置习惯。在 Windows 系统中添加了对 section 支持，通常用 .ini 作为后缀。面向对象语言的兴起，程
Linux下的软件安装
qq_44982981的博客
07-29 727
Linux下的软件安装一、软件安装包介绍1.1 软件包分类1.2 源码软件包1.2.1 这里我们使用C语言来编写一个简单的程序，然后来完成编译安装1.2.2 安装编译所需的工具软件gcc1.2.3 将C语言编写的程序编译生成二进制文件1.2.4 执行产生的二进制文件，测试效果1.3 二进制软件包1.4 附带安装程序的软件包1.5 源码软件包和二进制软件包特征1.5.1 源码软件包1.5.2 二进制软件包二、二进制安装包-rpm管理命令2.1 rpm软件包的命名规范2.2 rpm软件包的依赖关系2.3 软件的
GoDB3.4软件
04-15
网上很难找的GoDB软件，IPNC中的网页是由此软件设计。
go 调用winapi_Go语言开发Windows应用
weixin_36091906的博客
01-17 2014
当第一次看到Go程序在windows平台生成可执行的exe文件，就宣告了windows应用也一定是Go语言的战场。Go不是脚本语言，但却有着脚本语言的轻便简单的特性。相较于php和python之类以服务器控制台为主要战场的脚本语言来说，Go语言是真正的圆了“动态语言的应用开发梦”。Windows ApiWindows桌面应用依赖于win api，画出各种应用界面和控件本质上就是调用windows提...
oracle官方驱动 go,Windows + Golang + Oracle 11g + GORM（改） + go-oci8 的数据库驱动测试（超详细）...
weixin_36074841的博客
04-06 918
一、系统环境介绍：Windows 10Oracle 11g 64bitOCI -> instantclient-basic-windows.x64-12.2.0.1.0OCI SDK -> instantclient-sdk-windows.x64-12.1.0.2.0MinGW 64bitgo1.11 windows/amd64注意：我在Oracle 11g版本下使用 OCI 及 S...
go语言下载安装
程序三两行
10-19 8775
官网下载地址中文网下载地址（推荐，快速）根据自己电脑系统下载注意：下载 Windows 版本的Go语言开发包时尽量选择 MSI 格式，因为它可以直接安装到系统，不需要额外的操作。
Go安装各种第三方库，包命令
热门推荐
围巾的ACM博客
07-23 1万+
记录Go安装各种第三方库，包命令 安装Mysql的包 在go命令行中 go get github.com/go-sql-driver/mysql 安装goconfig的包 在go命令行中 go get github.com/Unknwon/goconfig 安装Protocol buffer包 go get -u github.com/golang/protobuf/pro...
GO.db:存储Gene Ontology信息的R包
庐州月光的博客
11-02 2498
欢迎关注微信公众号《生信修炼手册》！ 在生信分析领域，R语言由于其简单易用的特点和良好的生态环境，占用重要的一席之地。其中，Bioconductor作为生信分析专用的R语言社区，提供了许多的R包。 software类型的R包用于执行某项具体的分析内容，比如edgeR, DESeq2等，AnnotationData类型的包在R中存储了对应的数据库，比如GO.db等，ExperimentData类型...
R下载安装WGCNA
m0_63768606的博客
03-20 9240
记录并总结自己学习过程遇到的问题 刚开始学习WGCNA 在学习了相关的原理之后 想要按照官网的教程走一边 理解其中的代码 一 刚开始就遇到了这样的问题，没办法下载WGCNA包 Error: package or namespace load failed for ‘WGCNA’ in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]): 不存在叫‘GO.db’这个名字的程辑包 然后我尝试下载这个包 包括在Bioc...
(2)R包，GO.db调研（数据库构建角度解析）
Yujia's Blog
08-23 2115
本文从数据库构建角度，详解R包中的GO.db的构建方式；为开发相应数据库提供预备知识 目录 1.概述 2.GO.db的数据对象组成 3.GO.db中存储的数据对象的构建规则 4.GO.db的Sqlite数据库的表的结构 1.概述： R语言里的GO.db数据库的数据存储过程由两步组成：首先将基本的id号和definition等数据封装在GO.sqlite数据库里...
基因本体论数据库—R包GO.db
qq_27390023的博客
12-31 1373
GO.db: A set of annotation maps describing the entire Gene Ontology assembled using data from GO. library(GO.db) class(GO.db) # [1] "GODb" # attr(,"package") # [1] "AnnotationDbi" # ls and objects return a vector of character strings # giving the nam.
安装程序包‘GO.db’时退出狀態的值不是0
05-05
这种情况通常意味着安装程序包时出现了错误。可能有以下几种情况： 1. 安装程序包时出现了网络连接问题，导致下载失败。 2. 安装程序包时出现了依赖问题，缺少其他程序包或库。 3. 安装程序包时出现了权限问题，...
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