发现这个问题在\v3d_external\bin\plugins\neuron_utilities下有
1.swc_to_maskimage_cylinder_unit
2.swc_to_maskimage_sphere_unit
两个插件可以完成。
swc_to_maskimage_sphere_unit在…\vaa3d_tools\released_plugins\v3d_plugins\swc_to_maskimage路径下
问题描述如下:在一些swc后处理时,需要判断某些区域是否已经被追踪过、或者离当前坐标点最近的已经被追踪的点在哪,但是在swc文件中,提供的仅仅是点以及点之间的连接关系。
display_neuron_swcformat_FL
已经有的:
…\v3d_external\v3d_main\neuron_matching 路径下的
display_neuron_swcformat_FL.m
能够采用matlab的代码,通过plot3的形式输出三维的图像。
下图为display_neuron_swcformat_FL.m的结果
功能
- 输入两个变量 1.原图像(或图像的size) 2.swc
- 输出与原图像维度相同的新图像,该图像与swc形状相同。
Swc的后处理,可能需要预先判断某一个区域,是否被追踪,甚至更精确的说是是否被指定的枝追踪,因此有必要创建一张图像,以标记这种情况。