注释数据库介绍之GO、KEGG数据库

做过测序的小伙伴肯定都知道GO、KEGG数据库，我们想要知道基因发挥什么功能、参与什么途径，就一定要看基因功能注释的结果，而GO、KEGG这两个数据库是基因功能注释常用的数据库，也是常常出现在测序文章中，但是你真的了解这两个数据库吗？

 

GO数据库

 

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GO数据库的命名

GO(gene ontology)是基因本体联合会(Gene Onotology Consortium)建立的数据库。目的在于建立对基因和蛋白质功能进行限定和描述，可以适用于各个物种，并且随着研究不断深入而更新的语言词汇标准。GO是多种生物本体语言中的一种，提供了三层结构的系统定义方式，用于描述基因产物的功能。

 

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GO数据库的定义

Gene Ontology (GO)为了能够使对各种数据库中基因产物的功能描述相一致，发展了具有三级结构的标准语言（ontologies）。根据基因产物的相关分子功能，生物学途径，细胞学组成而给予定义，无物种相关性。目前，GO的定义法则已经在多个合作的数据库中使用，使得这些数据库在查询时具有很高的一致性。例如，GO可以被用来在小鼠基因组中查询和信号转导相关的基因产物，也可以进一步找到各种生物的受体酪氨酸激酶。这种结构允许在各种水平添加对此基因产物特性的认识。

 

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