python-打开文件输出到文件

最新推荐文章于 2023-07-14 17:37:18 发布

A Dluter

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分类专栏： python 文章标签： python numpy

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AF2 输出结果中有 .pkl文件，pkl文件是python的一种存储方式，将python项目中一些暂时变量、需要提取字符串、列表、字典存储成pkl格式的文件。用python 的open、load读取pkl文件

>>> import pickle
>>> file = open('result_model_1.pkl','rb')
>>> info = pickle.load(file)
>>> print(info)
{'distogram': {'bin_edges': array([ 2.3125  ,  2.625   ,  2.9375  ,  3.25    ,  3.5625  ,  3.875   ,
        4.1875  ,  4.5     ,  4.8125  ,  5.125   ,  5.4375  ,  5.75    ,
        ....
        'logits': array([[[ 1.75906189e+02,  9.28460693e+00, -9.83583450e+00,
        ......
         'experimentally_resolved': {'logits': array([[-3.5461054 , -3.4740696 , -3.5472293 ,
         ......
          'masked_msa': {'logits': array([[[ -0.42031673,  -0.6255729 ,  -0.7225212 ,
          ......
          'predicted_lddt': {'logits': array([[-5.167703 , -6.0159936, -5.120105 ,
          ......
          'structure_module': {'final_atom_mask': array([[1., 1., 1., ..., 0., 0., 0.],
          ......
          'final_atom_positions': array([[[-22.728607 , -18.613485 ,  14.481185 ],
          ......
          'plddt': array([51.03757247, 60.50900358, 58.30158118, 
          ......
           'ranking_confidence': 93.50815556758259}
>>> log = open("result_model_1.txt","w")
>>> print(info, file=log)