转录组学专题

近年来，随着高通量测序技术的迅猛发展，转录组研究从以前的微阵列技术，SAGE及MPSS技术的低通量模式切换至RNA-seq的高通量模式。转录组学作为一个伴随高通量测序技术率先发展起来的技术开始在生物学前沿研究中得到了广泛的应用。RNA-seq对于真核生物的基因表达调控，癌症等疾病的发生机制和新治疗方案确定，遗传育种等众多方面的研究具有不可估量的潜力。为了辅助广大科研工作者掌握转录组高通量测序技术原理、实验设计以及后期数据分析技能，举办“转录组学”专题实战班。欢迎报名参加。更多消息可关注“生信会议”公众号，会给您带来更多惊喜！

主办单位：北京市计算中心有限公司

协办单位：

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

工业和信息化人才培养工程培训基地

北京市大数据教学实践基地

日期	主题	内容	备注
第一天	转录组学前沿概述及测序原理	1.转录组技术发展前沿动态 2.转录组应用案例及应用热点 3.常用的转录组实验设计及测序建库技术 4.单细胞转录组测序技术 5.转录组技术流程及技术细节	理论
	Linux服务器使用入门	1.掌握Linux系统下的常用命令（重点讲解） 2.掌握Linux环境下软件的安装使用 3.了解Shell脚本的编写	上机操作
第二天	转录组分析方法	1.差异表达基因的功能分析（重点讲解）	理论
	De novo转录组数据分析上机实践	1.原始测序数据的检测和预处理（重点讲解） 2.使用Trinity拼接转录组数据（重点讲解） 3.原始数据与拼接转录本的比对（重点讲解） 4.表达量统计和差异表达分析（重点讲解） 5.使用blast对转录本进行功能注释（重点讲解） 6.寻找转录本的ORF，翻译蛋白质序列 7.转录因子注释	上机操作
	Reference based转录组数据分析 上机实践（一）	1.转录组数据准备和软件介绍 2.使用HISAT进行转录组数据的比对（重点讲解） 3.用IGV查看比对结果 4.使用cufflinks进行表达量估计和分析（重点讲解） 5.使用samtools检测转录组数据中的突变（重点讲解）	上机操作
第三天	Reference based转录组数据分析	1.lncRNA的定义、应用和发展 2.lncRNA的生物学过程 3.lncRNA研究的实验设计及测序原理 4.lncRNA测序分析结果解读	理论
	Reference based转录组数据分析 上机实践（二）	1.利用tophat和cufflinks组合，预测转录本 2.使用CNCI预测新的lncRNA转录本（重点讲解） 3.使用LncTar软件预测lncRNA调控的靶基因（重点讲解）	理论+ 上机操作
	microRNA测序与数据分析	1.microRNA的定义、应用和发展 2.microRNA的生物学过程 3.microRNA研究的实验设计及测序原理	理论
	microRNA测序与数据分析（包含上机实践）	1.microRNA测序数据分析软件（重点讲解） 2.microRNA测序数据预处理（重点讲解） 3.microRNA的预测（重点讲解） 4.microRNA靶标基因预测，结果提取、统计（重点讲解）	理论+ 上机操作

课程详情https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU2MDkyMTA2Nw==&mid=2247486633&idx=1&sn=08d063a7c839aac204eed8bb6ccd4449&chksm=fc01ec2dcb76653b652b9dca0d396fc71ef76f830a506827d34924de552401d5c523513ec417#rd