Fisher卡方检验 & 配对卡方检验案例教程

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于 2024-10-28 17:44:54 发布

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文章标签： SPSSAU spss 卡方检验

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一、Fisher确切概率

Fisher确切概率法是由R.A.Fisher(1934)提出的，其理论依据是超几何分布，是一种直接计算概率的假设检验方法。由于其在四格表中应用最为广泛，所以也直接称为四格表确切概率，此外它也可在R×C表卡方检验条件不满足时使用。

1. 2×2四格表资料

当2×2四格表资料出现E≤1或n﹤40情况时，可使用Fisher确切概率进行假设检验。此外当四格表卡方检验后所得概率p值接近检验水平α时，亦可使用Fisher确切概率。

【例4-11】四格表Fisher确切概率。将23名抑郁症患者随机分到两组，分别用两种药物治疗，结果见表 4-35，问两种药物的治疗效果是否不同。数据来源于方积乾(2012)，数据文档见“例4-11.xls”。

（1）数据与案例分析

数据文档为加权数据格式，根据适用条件，本例四格表资料的样本量n﹤40，Pearson卡方、Yates校正卡方不再适用，宜采用Fisher确切概率法进行分析。

（2）卡方检验

四格表资料的Fisher确切概率可直接通过【卡方检验】模块实现，将“组别”拖拽至【X(定类)】，“疗效”拖拽至【Y(定类)】。本例需加权处理，故再把“频数”拖拽至【加权项(可选)】。选项框内模型选择【百分数(按列)】，最后单击【开始分析】。

本例n = 23﹤40，且有单元格1≤E﹤5。因此Fisher确切概率结果更为可靠。如表 4-36所示，确切概率p=0.142，在α=0.05检验水平上尚不能认为两药治疗抑郁症的效果不同。

2. R×C列联表资料

R×C列联表Pearson卡方检验要求列联表中所有的单元格理论频数不应小于1，并且1≤E﹤5的单元格数量不宜超过总数的1/5。如果出现不符合该条件的情况，研究者可考虑采用Fisher确切概率法进行差异检验。

在SPSSAU中，可通过【实验/医学研究】下的【卡方检验】或【fisher卡方】两个模块实现Fisher确切概率法。

【例4-12】R×C表Fisher确切概率。某研究回顾性分析62例NME乳腺癌患者MRI影像及临床病理资料，其中不同分子亚型在有无瘤周水肿的分布数据见表 4-37。试分析四种亚型在瘤周水肿的分布有无差别。数据来源于晋瑞，张冰等 (2019)，数据文档见“例4-12.xls”。

（1）数据与案例分析

本例数据是4×2列联表数据，有8个单元格频数，总样本量n=62﹥40。通过【卡方检验】模块进行分析后，我们发现1≤E﹤5的单元格数比例为37.5%，超过了1/5的单元格数，Pearson卡方不再适用，此时宜采用Fisher确切概率法进行检验。

（2）Fisher确切概率

【卡方检验】模块只提供2×2四格表资料的Fisher确切概率，针对R×C列联表我们使用【Fisher卡方】模块。该模块无需录入数据，而采取直接输入频数数字的方式进行假设检验。

图 4-15 Fisher确切概率操作界面

在仪表板中依次选择【实验/医学研究】→【Fisher卡方】模块，在电子表格区域直接手动输入案例数据，具体设定如图 4-15所示，最后单击【开始分析】。

（3）结果分析

特别强调，Fisher确切概率法是直接计算假设检验的p值，因此中间并无统计量，结果如表4-38所示。

经计算，本例Fisher确切概率p值=0.001﹤0.05，认为四种不同分子亚型在留瘤周水肿上的分布差异有统计学意义。

二、配对卡方检验

前面介绍的是成组设计的卡方检验，比如两组或多组率的比较，此处的组就是各自独立的对象。与成组设计对应的是配对(或配伍)设计。

配对设计的特点是对同一样本分别用A和B两种方法处理，或是对样本前后测量，观察其水平分布的差异或一致性。若采用配对设计，结局指标为计数资料时，则需要采用配对设计的卡方检验方法。

如果是配对四格表资料，则使用McNemar检验；其他非四格表的配对资料，则使用McNemar-Bowker检验，二者的区别如下表 4-39。

【例4-13】124个学生1000米长跑，训练一个月前后两次测验达标情况如下表 4-40所示，问一个月的训练是否有显著效果？数据来源于王孝玲(2007)，数据文档见“例4-13.xls”。

（1）数据与案例分析

数据文档为加权数据格式，包含3个变量。标题分别为“第一次测验”、“第二次测验”和“频数”，两次测验的结局均为“达标”和“未达标”。每个学生均有前后两次测验，并且测验的结局均为“达标”或“不达标”，这是配对设计的定类数据资料。综合这两点，不适用于前面学习的普通成组设计的卡方检验，而应采用专门用于配对设计的卡方检验方法。