lammps 安装kokkos MPI 实现GPU计算

lammps新版本使用GPU计算，需要C++11的支持，因此GCC版本应大于等于5
CUDA版本需大于12，驱动需新一些

(驱动参考)

NVIDIA-SMI 525.147.05   Driver Version: 551.23       CUDA Version: 12.4 nvcc 12.3
 

但凡安装出错都在于CUDA（版本），MPI（是否支持CUDA）,GCC（是否支持c++11）的问题

###安装openmpi

wget https://download.open-mpi.org/release/open-mpi/v4.1/openmpi-4.1.4.tar.gz
tar -xvf openmpi-4.1.4.tar.gz 
./configure --prefix=/opt/openmpi-cuda --with-cuda
make -j 12
sudo make install

###lammps
wget https://download.lammps.org/tars/lammps-stable.tar.gz
tar -xvf lammps-stable.tar.gz
cd lammps-23Jun2022/lib/gpu 

vim Makefile.linux 修改如下内容：
  CUDA_HOME =/usr/local/cuda  #cuda安装地址，我这里不用改，因为cuda位置在默认位置安装的
  CUDA_PRECISION = -D_SINGLE_DOUBLE    #单精度和双精度混编，这个是默认的，我们这里不更改，既能保证误差小的情况，也不至于速度特别慢。
  CUDA_ARCH = -arch=sm_86 #3060是这个样

make -f Makefile.linux -j 12

cd ../../src
make yes-REAXFF    #需要其他力场就重新到src文件夹下，make yes-XXX，再
make yes-KOKKOS
make yes-KSPACE
make kokkos_cuda_mpi -j10
make yes- EXTRA-COMPUTE

vim ./src/MAKE/OPTIONS/Makefile.kokkos_cuda_mpi

修改  KOKKOS_ARCH=AMPERE86（对应显卡的sm架构）

make kokkos_cuda_mpi -j12
后当前目录下会出现lmp_kokkosXXX可执行文件，加入环境变量即可使用

参考指令参数（计算化学的大佬懂的）

 mpirun -np 4 lmp_kokkos_cuda_mpi  -nocite -k on g 1 -sf kk -pk kokkos newton on neigh half -in in.flux